Nye diagnosemetoder til udsædsbårne sygdomme Delprojekt under ORGSEED Mål: Hurtigere og mere specifikke analysemetoder til udsædsbårne sygdomme Plantedirektoratet og DJF
Sygdomsanalyser Konventionel PCR Artsspecifik - + Tidskrævende - + Individuelle grænseværdier +-
Usædsbårne sygdomme i byg Pyrenophora graminea Imperfect: Drechslera graminea Pyrenophora teres Imperfect: Drechslera teres
Konventionel test for Pyrenophora sp. Væksthustest 4-5 uger Fryse-blotter metode, 7 døgn
Grænseværdier for bladplet og stribesyge P. teres P. graminea C1 C2 15% 0%5%
Real-time PCR metode for stribesyge Stribesyge Bladplet + andre
Sammenhæng mellem mængden af DNA og antallet af inficerede kerner
Kassationsprocenter i økologisk udsæd af vårbyg med bladplet/stribesyge År Kass. % u. PCR Kass. % m. PCR PCR ikke anvendt Nielsen 2005, Planteavlsorientering Nr
Spireskadende svampe Fusarium graminearum Fusarium culmorum Fusarium avenaceum Microdochium nivale
Sammenhæng mellem konventionel/ PCR metode og fremspiring % inficerede kerner (konventionel test ) % fremspiring i mark Fusarium/Microdochium DNA (PCR test)
Konklusion PCR test til specifik detektion af stribesyge er blevet udviklet og anvendes af Plantedirektoratet PCR test til Fusarium arter og M. nivale er blevet udviklet -Forsøg indikerer at PCR og konventionel test er ligeværdige mht. at estimere fremspiringen i marken