Molecular analysis of the evolutionary significance of UV-vision in vertebrates Yongsheng Shi and Shozo Yokoyama*

Slides:



Advertisements
Lignende præsentationer
Historien om Jørgen Finke
Advertisements

LIVET.
Sygepleje i korttidsafsnit
Lysets Natur Lys og Farver.
Fugle som indikatorer for biodiversiteten i de danske naturtyper
EVOLUTION.
Skovøkosystem Målgruppe: Elever i folkeskolen Brugskontekst:
Moderne genteknologi Celler som fabrikker.
Recovery gennem lokalsamfundsdeltagelse
Våd Kemi v NIR måling Våd kemi NIR måling Dyr Hurtig og billig
Fuld fart frem… anderledes måde.. Hvorfor skal vi være innovative/entreprenante? Den globale udfordring Vi skal konkurrere på produkter og services.
Hvad er et problem ? Et problem er i sin negativt ladede betydning en for nogle utilfredsstillende situation. Et problem er i sin positivt ladede betydning.
Naturvidenskabeligt Grundforløb
Evolution.
ALT eller intet Om græsning og småpattedyr. Undersøgelser viser at flest arter og individer af småpattedyr i det åbne land findes i områder med permanent.
Katte lavet af Martin og Daniel
I begyndelsen skabte Gud himmelen og jorden
Hvad ser du på næste side?
Gør det simpelt Trænings planlægning.
1.1 · Fiskens ydre Kilde: Efter Åse Jespersen & Jørgen Lützen.
Jørgen Haagen & John Andersson UCSJ
Evolutionen af ultraviolet syn hos vertebrater. Shi, Y. & Yokoyama, S. 2003: Molecular Analysis of the evolutionary significance of ultravolet voision.
Økologi.
Projekt 6: Molekylær Evolution Af Keratin Proteiner Vejleder: Rasmus Nielsen.
Hubbles lov. To linier fra Calcium II følges Fig p599.
Vi har en flad hierarkisk struktur
Udviklingen i pesticiders belastning af miljøet i perioden Kim Gustavson, DHI
Genom-screening med Illumina SNP-array
Ældre, IT og læring. Ældre tæmmer teknologien..
OSMOSE OG DIFFUSION STOFTRANSPORT.
PROTEIN Af Leif D. Hansen.
The KaosPilots August Arne Kleven og & friends Opgaven Introduktion til analysen Praktisk gennemførsel - personlig tilbagemelding.
Fordøjelseskanalen.
Bakterie og virus.
Darwinisme Jannik, Julie og Louise 2.b. Evolution postulatet - 2 elementer – evolutionspostulatet - evolutionspostulatet = han starter en teori om at.
Opfattelse i gamle dage DNAMutationRekombination Menneskets påvirkning.
Arealregulering, helhed eller kun husdyr? Per Nørmark.
Rosalind Franklin f – d.1958 Francis Harry Compton Crick
Carl Winsløv ”Didaktiske elementer”
En biokemisk karakterisering af et hvilket som helst protein kræver at vi har noget rimeligt rent, oprenset aktivt protein. Oprensning kræver vi har et.
Fedt, protein og kulhydrater
Hvordan bevares agerlandets naturtyper?
Strategi i Vindervirksomheder Kapitel 2
Version 1.0 d LPJ EK Netværk Ledelse og coaching - et forum for ledere i EK, der ønsker at udvikle sine kompetencer inden for coaching Gruppen.
Bio-informatik Søgning efter og karakterisering af mikro RNAer.
Fedtopløselige vitaminer
Antimikrobielle Peptider -fremtidens antibiotika?
En dag da Leo var på til skole, så han to drenge som lige havde malede med graffiti. Det synes Leo er sejt, De to drenge gå forbi Leo og går mod skolen.
Databehandling og formidling
Opgave 10 Erhvervsøkonomi / Managerial Economics
Evolution af komplekse organismer -baseret på: ’RNA regulation: a new genetics?’ John S. Mattick.
GRUPPE 6.
Evolutionens historie
Lineær Programmering.
Jakob Fredslund, datalog, phd.
Leonardo da Vinci.
Tidslinje Charles Darwin.
Leonardo da Vinci.
Præsentation 2: Hvad er nano?. Hvad er nano? ETUI-pilottræningskursus om nanomateriale april 2015 København (DK) Nanoteknologi.
Kroniske sundhedsskader
Padder 6.b Lavet af Pelle, Lærke, Clausen & Enan.
Comparative Method Uge 38
Fotoaktive proteiner – atomfysiske motoder anvendt på biologiske problemstillinger Lars H Andersen IFA.
Hvad er en Amniot Tetrapode vertebrater
PROTEINSYNTESEN I genetikken
Økologiske sammenhænge
Niveau 3: Regressionsanalyse: Tværsnitsundersøgelser
Genetik.
Ryggdýr Ryggdýr er dyr med ryghvirvler
Præsentationens transcript:

Molecular analysis of the evolutionary significance of UV-vision in vertebrates Yongsheng Shi and Shozo Yokoyama*

Artiklens hovedspørgsmål Havde den fælles vertebrat stamform UV- syn? Hvordan er UV-syn opstået og mistet i de forskellige organismer? Har UV-syn en adaptiv værdi?

UV-syn λ max = 350 – 400 nm Findes i : fisk,fugle,pattedyr, amfibier,reptiler Bruges til: kommunikation,føde- søgning, pardannelse

Øjets opbygning Nethinde med fotoreceptorceller

Fotopigmenter: Består af: Opsiner (TM-protein) Kromofor (fx vitamin A)

Opsiner: Vertebrater har 4 forskellige opsiner SWS-1 er UV-sensitiv: - TMI-VII –helix (C-og N-terminus er ikke involverede i UV- sensitivitet)

Metoder: valg af stamformer

Metoder: Rekonstruktion Computerbaseret rekonstruktion af SWS1 via: Bayesian (posteriore probabilities) Efterprøvning via empiriske modeller: JTT Dayhoff

Metoder: Rekonstruktion In vitro rekonstruktion af SWS1: Punktmutationer og rekombination af SWS1- sekvenser Kloning Inkubering med kromofor Måling af absorbans

Resultater: Stamformspigmenterne a-g er alle UV- sensitive Pigmentet f (fugle-stamformen) er violet sensitiv (λ max = 393 nm) Fugle-SWS1 er UV-sensitiv: S90C Nyt aa-site involveret i spektral indstilling (L116V) UV-sensitivitet i en række dyr bevaret

Forholdsregler/kontroller: Måling af absorbans: kontrol med H 2 SO 4 (der bryder binding mellem kromofor og opsin)

Forholdsregler/kontroller: Kun TMI-VII-regionen afgør UV- sensitivitet: Chimera proteiner (C- og N-terminus byttes rundt mellem arter)

Forholdsregler/kontroller: Almindeligt forekommende aa- er ikke involveret i UV-sensitivitet: Sekvenserne erstattes af tilsvarende sekvenser fra andre arter / sites med lavere posteriore probabilities

Forholdsregler/kontroller: Fuglenes UV-sensivitet afhænger ikke af indbyrdes topologi: Posteriore probabilities viser at der ikke introduceres nye aa

Konklusion  Havde den fælles vertebrat stamform UV- syn? - Ja (men har den haft den neronale kapacitet til at bearbejde og registrere UV- lyssignalet?)

Konklusion Hvordan er UV-syn opstået og mistet i de forskellige organismer? - UV-syn er bibeholdt i en del organismer (fisk,salamander,kamæleon, mus og rotte), mistet i andre organismer (fx mennesket) og genopstået hos adskillige fuglearter

Konklusion Har UV-syn en adaptiv værdi? - Sandsynligvis:  coelacanthen og delfinen har mistet UV- syn  mennesket kan have mistet sit pga potentielle skadevirkninger  fugles migration  nogle fisk har UV- syn på bestemte tidspunkter i deres udvikling.