Beredskab i forbindelse med stikprøvekontrol og fund af Ringbakteriose Charlotte Thrane Plantedirektoratet

INDHOLD Kartoffelprøvens gang i laboratoriet EU-ændringer Overvågning (survey) Suspekte prøver og positive fund EU-ændringer Analyser af kartoffelprøver i næste sæson?

Rystning af navleender

EDB-registrering af prøven

Opkoncentrering af prøven

Gemmeprøver Halvdelen af prøven anvendes til den indledende undersøgelse Der opbevares to prøver i fryser: Evt. ægplantetest Referencemateriale Der gemmes yderligere kartoffelrystevand i fryser

IF-mikroskopi

IF-test Polyklonalt antistof Monoklonalt antistof Stærkt lysende Stor sandsynlighed for at finde Ringbakteriose-bakterier En risiko for falsk positive bakterier Monoklonalt antistof Der findes pt. kun ét på markedet og det er af relativt dårlig kvalitet Nogen risiko for falsk negative resultater Lav risiko for falsk positive resultater

Kontrolløren udtager kartoffelprøven hos avler Prøven modtages i Plantedirektoratets laboratorium Udvinding og opkoncentrering af kartoffelekstrakt fra navleender fra kartoffelprøven negativ IF-test Analysebevis tilgår avler fra Plantedirektoratets laboratorium suspekt Brev tilgår avler fra Sektor for Planter og Plantesundhed vedr. mistanke om fund af Ringbakteriose Alternative hurtigmetoder PCR IF (alternativ) negativ suspekt suspekt negativ Ægplantetest og identifikation af renkultur positiv Analysebevis og restriktionsbrev fremsendes af Sektor for Planter og Plantesundhed

PCR DNA-fingeraftryk

Ægplantetest

Ringbakteriose bakterier IF-test

Akkrediteret analyse DANAK Officiel analysemetode Kvalitetsstandard Oplæring af personale Forsøgsprotokoller Dokumentation Afvigelser Ringtests

Ændringer i EU-direktivet for Kontrol af Ringbakteriose (Forventede ændringer!) Forsigtighed fra EU-kommisionens side Kun annekser berørt af ændringsforslag

Testmetoder Nye metoder Mere ensartede detektionsgrænser metoderne imellem Definering af krav til analysens kvalitet Mindst 2 forskellige laboratorieundersøgelser skal være positive før en prøve må anses som suspekt Ægplantetesten forbliver Knoldene skal gemmes indtil analysen er afsluttet

Sammenligning af detektionsgrænser ved forskellige analysemetoder Test/prøve 1 2 3 4 5 6 7 8 IF + ELISA - Ægplantetest nt* nt PCR-Pastrick +/+ Tabel 1 Oversigt over de testede metoders følsomhed. Et plus (+) markerer at der ved metoden har kunnet påvises Cms. * nt=ikke testet.

Biologisk forskellige principper Analyse Biologisk princip IF Serologisk test (antistof) Genkendelse af bakteriens overfladestruktur DNA-baseret PCR (”genetisk fingeraftryk”) Genkendelse af særegent genetisk arvemateriale FISH (Mikroskopi) Ægplante Patogenitet Kan bakterien fremkalde karakteristiske symptomer på planten?

Overskæring af knolden Visuel undersøgelse for symptomer

Renkultur identificeres 1. screeningstest IF eller PCR negativ Analysebevis tilgår avler fra Plantedirektoratets laboratorium suspekt Brev tilgår avler fra Sektor fra Planter og Plantesundhed vedr. mistanke om fund af Ringbakteriose suspekt 2. screeningstest IF eller PCR negativ suspekt negativ Ægplantetest suspekt Renkultur identificeres positiv Analysebevis og restriktionsbrev fremsendes af Sektor for Planter og Plantesundhed