Beregning af GEBV ud fra DGV og fænotypiske registreringer (blending) Jørn Pedersen Ulrik S. Nielsen Gert P Aamand Anders Fogh.

Slides:



Advertisements
Lignende præsentationer
Den danske befolknings syn på handicappedes rettigheder
Advertisements

Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk testdagsmodel for ydelse Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Indvandrere og efterkommere i grundskolen Niels Egelund, professor, dr
Fra registrering til indeks, samt genomisk selektion
Heatime – hurtig og enkel registrering af brunst
Nyt fra I NTERBULL og fremtidige udviklingsopgaver Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
1 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Overgang til testdagsmodel Tyrenes ændringer i avlsværdital for ydelse Anders Fogh Afdeling for Specialviden.
Avlsværdital for ungdyrdødelighed Line Hjortø Buch.
Nordisk Avlsværdivurdering Derfor skal vi have nye metoder i avlsværdivurderingen! Hvad sker der på nordisk og internationalt plan? Ved direktør Gert Pedersen.
1 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Overgang til testdagsmodel Anvendelse af data i testdagsmodellen Anders Fogh Afdeling for Specialviden.
Nordisk Avlsværdi Vurdering • Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk avlsværdivurdering for køer Klovsundhed for genomisk testede tyre August 2012 Anders.
AHV Avlsmålsegenskaber •Vægtning af nuværende indeksegenskaber blev opdateret i marts •Nye egenskaber på vej? –14 G (pasningsevne)
v/ Professor Lars Ehlers, Aalborg Universitet
Landbrugets indtjeningsevne sammenlignet med de øvrige EU lande
Paratuberkulose Udskrifter
InSire.
Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk testdagsmodel for ydelse Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Nordisk Avlsværdi Vurdering • Nordic Cattle Genetic Evaluation Blendede avlsværdital hos køer Jørn Pedersen Ulrik S. Nielsen, Gert P. Aamand, Anders Fogh,
Resultater af forsøg med handelsgødning samt mellem- og efterafgrøder
Dialogmøder 2012 De private tilbud og kommunerne - fælles udfordringer og muligheder Geert Jørgensen.
Økonomi i anvendelse af GS, KSS og kødkvæg
Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Nordisk Avlsværdivurdering Dansk Kvæg ”Teknikken” i testdagsmodellen(1) Jørn Pedersen Dansk Kvæg, Afdeling for.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Procedurer for rettelse af afstamning på genotypede dyr Kevin Byskov og Anders Fogh.
SNP håndtering og datavalidering Kevin Byskov. Disposition Principperne bag genotypning Kontrolprocedurer: Kontrol af Sample ID Mendel Error Check Kontrol.
Opbygning af en reference- population for nye (og gamle) egenskaber L.H. Buch, M.K. Sørensen og A.C. Sørensen.
Praktiske overvejelser ved brug af Genvikplustyre Informationsmøde om avl 12. oktober 2010 Morten Kargo.
Anders Fogh Mette Sandholm
Lektion 6: Kvantitative egenskaber, avlsværdi og heritabilitet
Hvordan kan valget af foder påvirke mælkens kvalitet? John E. Hermansen og Kristen Sejrsen Danmarks Jordbrugsforskning.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Erfaringer med genomiske avlsværdital Informationsmøde 9. oktober 2012 Ulrik Sander Nielsen.
HUSKESPIL – den lille tabel
Østjysk rapport om udligning og tilskud Seminar om udligning den 26. April 2010 Job og Økonomidirektør Asbjørn Friis Jensen, Favrskov.
 2 3  3 =  83  43  53  63  73  93  10 4.
Fra registrering til indeks, samt betydningen af valg af avlstyr
Nyt program til beregning af eksteriørtal Informationsmøde 12. oktober 2010 Jacob Edstrand og Anders Fogh.
Informationsmøde Den 9. oktober 2012 Anders Fogh Information til besætningsejere, som tester hundyr.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nyt fra NAV Gert Pedersen Aamand.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Udviklingsopgaver og nyt fra Interbull Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Ukrudtsbekæmpelse Jens Erik Jensen
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Beregningsprocedure og offentliggørelse af avlsværdital Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Nye genetiske parametre for ydelse Anders Fogh og Kevin Byskov.
v/direktør Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering
Matematik B 1.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nyt fra Interbull og NAV udviklingsaktiviteter Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Avlsmæssig anvendelse og resultater hos tyre Anders Fogh Informationsmøde 2011.
Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh
Grunde til at jeg elsker dig
Danske klovdata Kevin Byskov og Pia Nielsen. Disposition Antal klovbeskæringer i Danmark, Sverige og Finland Hvad viser de danske registreringer Inden.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Andre aspekter af genomisk selektion Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Optimalt insemineringstidspunkt ved brug af Heatime Søs Ancker, Specialkonsulent VFL Kvæg.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Klovproblemer Hvilke avlsmæssige tiltag kan vi gøre? Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Nordisk Avlsværdivurdering Maj 2005 NAV. Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk avlsværdivurdering Hvem, hvad og hvorfor NAV.
Avlsplaner med eller uden genomisk selektion og afkomsundersøgelse L.H. Buch, M.K. Sørensen, P. Berg, L.D. Pedersen og A.C. Sørensen.
Avlsværdital for klovsundhed Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson Kjell Johansson Jukka Pösö Morten Kargo Sørensen Ulrik Sander Nielsen Gert Pedersen Aamand.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Informationsmøde 2014 NAV avlsværdital for ungdyroverlevelse Jørn Pedersen, Jukka Pösö, Jan-Åke.
Anders Fogh og Mette Sandholm
Husstandsmøller / solceller
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Avlsmål i Norden Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen.
Internationale avlsværdital på unge tyre Gert Pedersen Aamand, Ulrik Sander Nielsen og Anders Fogh STØTTET AF mælkeafgiftsfonden Videncentret for Landbrug.
Avlsmæssig anvendelse og resultater hos hundyr Anders Fogh Informationsmøde 2011.
NAV avlsværdital for yversundhed Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Landskonsulent Karsten A. Nielsen Strategi for valg af kløvergræsblanding sammen med kvælstofgødskning Den Europæiske Union ved Den Europæiske Fond for.
Nyt fra Interbull Gert Pedersen Aamand og Ulrik Sander Nielsen Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Den Europæriske Landbrugsfond.
Kontrol af indberettede afstamningsoplysninger Delprojekt af Brugbare Data Kevin Byskov, Jørn Pedersen og Anders Fogh.
Fra SNP til DGV Ulrik Sander Nielsen og Anders Fogh Informationsmøde 29. september 2011.
Imputation Kevin Byskov og Line Hjortø Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Den Europæriske Landbrugsfond for Udvikling af Landdistrikterne.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk prediktion Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik S. Nielsen Jørn Pedersen, Anders.
Velkommen til Lægaard UC-Holstebro
Informationsmøde 2014 NAV avlsværdital for ungdyroverlevelse
Præsentationens transcript:

Beregning af GEBV ud fra DGV og fænotypiske registreringer (blending) Jørn Pedersen Ulrik S. Nielsen Gert P Aamand Anders Fogh

Oversigt Beregning af GEBV: Egenskaber og data Resultater Avlsmæssig fremgang Spredning/sikkerhed Andel af kandidater blandt toptyre Ændringer når en kandidat får døtre

Trin i beregning af GEBV 0. Beregning af DRP: EBV og sikkerhed ( EBV omregnes til fænotypiske data) 1. Beregning af DGV: DRP og genomiske test-resultater(SNP) 2. Beregning af GEBV: DRP and DGV Kaldes 2-trins blending

Egenskaber 13 NTM-egenskaber Ydelse (samt Mælk, Protein, Fedt) Tilvækst Fødsel og kælvning Frugtbarhed, Mastitis, Sundhed, Holdbarhed (men ikke Klovsundhed) Krop, Lemmer og Malkeorganer Malketid, Temperament Desuden 22 eksteriør-egenskaber Planlagt: De enkelte frugtbarhedsegenskaber (9 egenskaber) Planlagt: De enkelte fødsels- og kælvingsegenskaber (12 egenskaber)

Hvilke data indgår i beregningen af GEBV Data fraMed EBV Med DRP Med DGVIndgårKommentar TyrNAV+++JAReference tyre/Afprøvede ÷÷+JAKandidat tyre +÷÷NEJÆldre/uaktuelle/ private tyre ÷÷÷NEJ”Almindelige” tyrekalve Eurogen+(IB)++JAReference tyre, kun HOL Kvie/koNAV+÷+JATestede køer (nu) ÷÷+JATestede kvier +÷÷NEJ”Almindelige” køer ÷÷÷NEJ”Almindelige” kvier

Beregningsmodel BLUP med 2 egenskaber: DRP og DGV DGV Vægt på DGV: Sikkerhed på DGV DRP Vægt på DRP: Afhænger af sikkerhed DRP/EBV Slægtskab: Via far og morfar (ikke AM)

Hvilke dyr får beregnet GEBV Alle dyr, som er med i beregningen “Afstamningsdyr”: Dyr, som er forældre til dyr med data (DRP og DGV) Reference tyre/afprøvede: Tyre med både DRP og DGV Kandidattyre: Tyre, som kun har DGV-information (kun genomisk testet) Kvier og køer: Kun DGV indgår (genomisk testet) Hvad bliver offentliggjort Kandidattyrenes GEBV (ældre end 20 mndr.) Kviernes GEBV + Køernes GEBV, undtaget for ydelse, mastitis og evt. eksteriør

Standardisering Spredning standardiseres ikke Bestemmes af oprindelig EBV og beregningen af DRP og DGV Gns. af GEBV = Gns. af EBV for: Nordiske tyre (født i DNK, SWE, FIN) og Stambogsførte insemineringstyre og Født

SD(EBV) : 9.9 SD(GEBV) : 7.6 Forskel i SD: Kommer af forskel i sikkerhed

SD(EBV) : 9.3 SD(GEBV) : 7.5 Forskel i SD: Kommer af forskel i sikkerhed

Spredning på kandidattyrenes GEBV NB: Ikke med i bilaget YdelseMastitis årHOLRDCJERHOLRDCJER Gns

% kandidattyre blandt top tyre Unge uafprøvede – men testede HOLRDCJersey- top 20 % Kandidattyre >20 mdr % Afkomsprøvede Mindste NTM

Korrelationer mellem EBV Korrelationer mellem GEBV

fra maj og august beregningen Tyre, som er kandidattyre i begge beregninger Ydelse Frugt- barhedMastitis Malke- org.Lemmer HOL RDC JER

Korrelationer mellem GEBV i maj - og EBV* i august Kandidat tyre i maj beregningen – afprøvede tyre i august beregningen, Tyre født 2006 og 2007 YdelseFrugtbarhedMastitis Malke- organerLemmer HOL RDC JER * NB: Sikkerhed på EBV er lav for disse tyre: De kan ændre sig en del i de kommende beregninger Antal HOL RDC JER1110(9)2427

Protein: 100 Frugtbarhed: 100 NTM: 0 Protein: 86 til 114 (SD dif = 7) Frugtbarhed: 88 til 112 (SD diff = 6) NTM: -13 til 13 (SD diff = 6.5) Forventede ændringer i avlsværdital, når en tyr skifter fra at være genomisk testet til være afkomsprøvet (95% grænser) Genomisk test Afkomsprøvet

Genomisk testet tyr og afprøvet tyr Betydning af sikkerhed FødtNavnNTMSand NTM D Jul to døtre 2009VH Cadiz to +46Genomisk test NTM har 50% chance for at stige eller falde for begge Stigningen eller faldet kan være større - jo lavere sikkerheden er

Hvad sker der, når en tyr får (flere) døtre? Genomisk testet tyr Sikkerheden stiger Risiko/chance for nogle ændringer Afprøvede tyre: Flere døtre Sikkerheden stiger en lille smule Risiko/chance for store ændringer er lav Ikke testede tyre: Afstamningsindeks erstattes af afprøvningsindeks Sikkerheden stiger meget Risiko/chance for store ændringer

Opsummering Rutinemæssig beregning af GEBV i maj og august trins metode GEBV for kandidattyre samt for testede kvier og køer Forventet stabilitet i resultater (ændringer i overgang fra kandidat til afprøvet tyr er større, end vi har været vant til – men det var forventet)

Anerkendelse Den Europæiske Union ved Den Europæiske Fond for Udvikling af Landdistrikter og Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri har deltaget i finansieringen af projektet. DNA-ordog