Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen.

Præsentationer af emnet: "Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen."— Præsentationens transcript:

1 Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh

2 Oversigt NAV-holdbarhedsprojektet Hvilke data indgår – og hvordan Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer Resultater, ændringer Base Udvikling over tid (trends) Korrelationer mellem det gamle og nye indeks Relation til andre egenskaber Værdi i NTM 2

3 Tidligere anvendte holdbarhedsmodeller DNK, FIN: Funktionel holdbarhed = ydelseskorrigeret Overlevelsesmodel (“Survival KIT”) SWE: Produktiv holdbarhed = ikke korrigeret for ydelse Lineær model med 3 egenskaber: Overlevelse til 2. laktation – enten-eller egenskab Overlevelse til 3. laktation – enten-eller egenskab Overlevelse til 4. laktation – enten-eller egenskab 3

4 Projektgruppens opgaver Formål: Udvikling af NAV avlsværdital for holdbarhed 3 race grupper: RDC, HOL(+DRH), JER Ens model for alle 3 lande Ens genetiske parametre for alle 3 lande Produktiv holdbarhed dvs. ukorrigeret for ydelse 4

5 Opgaver i projektet Definition af egenskaben (projektgruppen) Model Beregning af genetiske parametre Heritabiliteter– genetiske og miljømæssige korrelationer Analyser “Rekursiv” - proces 5

6 Holdbarhedsegenskaber DAGE11: Dage fra 1. kælving til slutningen af 1. laktation (informationsegenskab) DAGE12: Dage fra 1. kælving til slutningen af 2. laktation (informationsegenskab) DAGE13: Dage fra 1. kælving til slutningen af 3. laktation (avlsværdi) DAGE14: Dage fra 1. kælving til slutningen af 4. laktation (informationsegenskab) DAGE15: Dage fra 1. kælving til slutningen af 5. laktation (informationsegenskab) Maximalt 365 dage per laktation er inkluderet 365 dage per laktation, hvis koen overlever til næste laktation (dvs. ingen ”straf” for god frugtbarhed) DAGE13 er den avlsværdi, som bliver omregnet til et indeks og bliver publiceret 6

7 Edit of data Oplysninger om kælvninger og afgange kombineres Kun 1. til 5. laktation anvendes Køer, der indgår, har kælvet efter 1.1.1985 for DNK og SWE - og efter 1.1.1988 for FIN Alle køer skal starte med en 1. kælvning Alle kælvninger/laktationer, som indgår skal være fra samme besætning Efter besætningsskift anses observationerne for at være manglende (det der er i orden slettes ikke) Alder ved 1. kælvning skal ligge mellem 450 og 1280 dage Køer med ukendt fødselsdato indgår ikke 7

8 “Opportunity” perioder Eksempel: Hvis en ko afgår efter 20 dage i en laktation indgår oplysningen IKKE før den har haft mulighed for at leve 365 dage “Opportunity” perioder DAGE11: Oplysning anvendes først 365 dage efter 1. kælvning DAGE12: Oplysning anvendes først 365 dage efter 2. kælvning DAGE13: Oplysning anvendes først 365 dage efter 3. kælvning DAGE14: Oplysning anvendes først 365 dage efter 4. kælvning DAGE15: Oplysning anvendes først 365 dage efter 5. kælvning Vigtig oplysning: Dato for dataudtræk Dato for besætningsophør (dato for sidst kendte 1. kælvning) 8

9 Gennemsnit for HOL, RDM og JER med1. kælvning 2000-2004 9 DAGE11DAGE12DAGE13DAGE14DAGE15 HOL327539659719747 RDM327541663723751 JER323545685767813 Minimum00000 Maksimum365730109514601825

10 Animal Model Multi-trait med 5 egenskaber Effekter i modellen Alder ved 1. kælvning Kælvningssæson (år x måned - 1. kælvning) Besætning x 5 års periode (år for 1. kælvning) Heterosiseffekter (mange hos RDM/RDC) Genetiske grupper modelleret som fantom forældre (race x tid) Besætning x 1. kælvningsår (tilfældig) Ko (tilfældig genetisk effekt) 10

11 Genetiske parametre Heritabiliteter 11 DAGE11DAGE12DAGE13DAGE14DAGE15 HOL0.0350.0520.0620.0690.072 RDM0.0290.0440.0570.0660.072 JER0.0350.0510.0600.0630.064

12 Holstein genetiske korrelationer RDM og JER: Næsten samme resultater 12 DAGE11DAGE12DAGE13DAGE14DAGE15 DAGE110.940.890.860.84 DAGE120.990.970.96 DAGE130.9960.989 DAGE140.998 DAGE15

13 Oversigt – hvor er vi nået til NAV-holdbarhedsprojektet Hvilke data indgår – og hvordan Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer Resultater, ændringer Base: Generel ændring – tidsuafhængig Trends: Generel ændring – tidsafhængig Korrelationer: Individuelle ændringer Relation til andre egenskaber Værdi i NTM 13

14 Base ændringer Tidligere: Tyre født 15.8.2002 – 15.8.2004 August 2010: Køer født 15.8.2005 – 15.8.2007 Skyldes IKKE den nye model 14 Base ændring Virkning I NTM HOL÷6.5÷0.72 RDM÷2.0÷0.16 JER÷5.7÷0.68

15 Holstein – udvikling i holdbarhedsindeks 15

16 RDM – udvikling i holdbarhedsindeks 16

17 Jersey – udvikling i holdbarhedsindeks 17

18 Korrelationer mellem det gamle og det nye holdbarhedsindeks pr. år Tyre født 1997-2003 18 HOLRDCJER DNK0.810.770.73 FIN0.840.80 SWE0.860.84

19 19

20 Korrelationer pr. årgang: Individuelle ændringer Hvorfor så lave korrelationer? FIN, DNK: Ikke ydelseskorrigeret holdbarhed Lineær model versus ”overlevelse” – tidlig afgang lidt tæller mere SWE: Dage baseret – versus enten-eller Dage baseret mod laktationsbaseret (den gamle svenske model havde stor sammenhæng med frugtbarhed) Lidt lavere korrelationer i DNK - end i FIN og SWE Mange faktorer – ikke en enkelt afgørende faktor 20

21 RDC: Korrelationer med andre indekser Gns. pr. år i perioden 1997-2003 21 Ydelse Frugt- barhed Yver Sundh. Andre sygd.KropLemmer Malke org. DNKGl -0.10 0.100.510.25-0.300.210.32 Nyt 0.24 0.190.430.28-0.270.130.24 FINGl -0.27 0.330.520.31-0.140.110.40 Nyt 0.08 0.210.400.26-0.020.110.35 SWEGl 0.06 0.430.310.27-0.060.060.19 Nyt 0.25 0.300.29-0.100.070.19

22 Korrelationer mellem ny holdbarhed og andre egenskaber Tyre født 1997-2003 22 Ydelse Frugt- barhed Yver- sund- hed Andre syg- dommeKropLemmer Malke- organer HOL0.170.420.400.50-0.140.130.25 RDM0.240.190.430.28-0.270.130.24 JER0.140.120.470.29-0.150.260.27

23 Standardisering af variation Tyre født 1997-1998 23 Dage indeholdt i 1 indeksenhed RDCHOLJER DAGE111.151.251.34 DAGE123.704.154.09 DAGE136.757.247.12 DAGE149.439.649.59 DAGE1511.2911.1011.39

24 Værdi af holdbarhedindeks i NTM Basal økonomisk værdi er ikke påvirket (kr./dag) Hvordan kan en ændret metode ændrer værdi/vægt: Ændret definition af egenskaben: Principielt uændret Ændret indhold af en indeksenhed (standardisering af variationen) Specielt for holdbarhed: Overførslen af værdi til Yversundhed, Andre sygdomme, Frugtbarhed, Malkeorganer og Lemmer&klove Beslutning: Uændret vægtning (0.11, 0.08, 0.12 for HOL+DRH, RDM og JER) 24

25 Afslutning: NAV-holdbarhed Ny fælles model er udviklet Baseændring – skyldes IKKE den nye model Store ændringer i genetisk fremgang Lidt store individuelle ændringer Fremtidsplaner Evt. overlevelsesmodel 25

26 Anerkendelse Det Europæiske Fællesskab og Fødevareministeriet ved Direktoratet for FødevareErhverv har deltaget i finansieringen af denne aktivitet. DNA-ordog