Detektion af HIV med hhv

Slides:



Advertisements
Lignende præsentationer
“Forlægget ved den mundtlige prøve er eksaminandens synopsis, som er udarbejdet på baggrund af et problemområde, der er fundet egnet af læreren som eksaminationsgrundlag.
Advertisements

Nanopartikler i svejserøg
Blodprøver Hvor smitteudsættelse ikke kan udelukkes:
SEO (Search Engine Optimization) - Hvordan bliver du mere synlig på nettet?
1 Vollsmose - Imageundersøgelse Mediehus Vollsmose November 2009.
Udredning af allergi Kursusdag 1.
HPA-1a -En screening af bloddonorer
1 … med guiderne Thomas Kjær og Hanne Westerkam.
Moderne genteknologi Celler som fabrikker.
Profitten øget med økologiske tryksager! Kim T. Rasmussen, direktør UniFlip A/S.
”Roskildesyge” - infektion med norovirus
Dagsorden Kildekritik Litteraturliste Søgestrategi/søgeprofil Søgeord
Hvad gør vi i dag? Og hvordan…. Hvad gør vi i dag? Og hvordan…
  Diagnostik af urinvejsinfektion ved hjælp af urinstix hos kvinder i almen praksis.
MLPA (Multiplex ligation – dependent probe amplification)
1 Internetsøgning •Niveau 3 for Korte- og Mellemlange videregående uddannelser.
Analyse for Ældre Sagen: Trafikundersøgelse: Cykel, cykelhjelm mv Rapport Marts 2010.
Til finalen Lidt af hvert Vand I Vand II Reaktioner Opløsninger 100
Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.
Bærertilstand af gule stafylokokker i næse og svælg blandt raske danskere og sammenhængen med en CCR5 variant Joseph Khoa Dinh1, Lise Erikstrup2, Cecilie.
James Phipps Immunsystemet Edward Jenner ( )
T lymfocyt medierede funktioner
Opbygning af en reference- population for nye (og gamle) egenskaber L.H. Buch, M.K. Sørensen og A.C. Sørensen.
1 Velkommen! Informationssøgningsprocessen:  Hvordan kan I gribe det an (strategier)  Omdanne jeres emne til søgeord  Søgeteknik  Bruge søgeordene.
PAS farvning (Periodsyre-Schiff)
1 Med guiderne Thomas Kjær og Karen Rask Mortensen.
Enzymer.
Biostatistics mm5 SPSS crash course II. But why? Hvorfor læser vi videnskabelig litteratur? Hvordan læser vi?
Litteratursøgning Forskningstræning i speciallægeuddannelsen
Retrovirus historie 1983: HIV = Human Immunodeficiency Virus opdages
Betydning Sikkerhed Fokus på terror Økonomiske krise En verdens omvæltning.
Østjysk rapport om udligning og tilskud Seminar om udligning den 26. April 2010 Job og Økonomidirektør Asbjørn Friis Jensen, Favrskov.
AT8 3a 2010.
Homeostase / Regulering af kroppens indre miljø
Intro (navn, udd., informatør + bestyrelsen) – hvad vil jeg fortælle om og Hvor mange af jer har givet blod før? (håndsoprækning!)
Kan man undlade urinstiks kontrol 10 dage efter en behandlet UVI?
Cold-PCR & Droplet Digital PCR
Bør der foretages kontrolpodning af ikke-gravide kvinder efter endt klamydiabehandling i almen praksis? Et litteraturstudie af Heidi Ingerslev Christine.
Formalia ved opgaveskrivning
Den gode brugeroplevelse borger.dk får ny struktur og nyt design.
Doping Camilla & Linda.
Norsk topidretts-model ”Helhedsbeskrivelse for norsk bordtennis topidretts-satsning”
Eksamen psykologi synopsis synopsiseksamen 2013.
TB i DK Status 2007 Tuberkulin test og risiko for TB Torgny Wilcke Lungemedicinsk afd. Y Gentofte Hospital.
25. september 2007 Dias 1 Center for Sprogteknologi Evalueringsmetoder i MT Bente Maegaard og Lene Offersgaard Center for Sprogteknologi.
Studie rapport opbygning
Søgning i videnskabelige litteraturdatabaser
Disposition Præsentation af emne Mobning
Biologi i AT.
Comparison of systematic triage with clinical assessment in prediction of short-term mortality Anne Kristine Servais Iversen1, Jakob Lundager Forberg2,
Nye genetiske parametre for ydelse Anders Fogh og Kevin Byskov.
Litteratursøgning i forbindelse med bacheloropgave
Har vi gode og billige analysemetoder? (til fusarium – toksiner i korn og majs-ensilage) Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning.
Fundamentale datastrukturer
Disposition Kort introduktion til Phag  29 Forsøgsopstilling Resultater Perspektiver.
Campbell review om forebyggende hjemmebesøg Varme hænder og køligt overblik Oplæg om Campbell review om forebyggende hjemmebesøg, 29/ ,Camilla Thorgaard.
1 Fundamentale datastrukturer. 2 Definitioner: abstrakt datatype, datastruktur Elementære datastrukturer og abstrakte datatyper : arrays, stakke, køer,
Udvikling af immunforsvaret
Evolution af komplekse organismer -baseret på: ’RNA regulation: a new genetics?’ John S. Mattick.
Nye diagnosemetoder til udsædsbårne sygdomme Delprojekt under ORGSEED Mål: Hurtigere og mere specifikke analysemetoder til udsædsbårne sygdomme Plantedirektoratet.
Screening Automation Technologies. Automatiseret HTS Behov for automatisering af HTS Fordele og problemer Nødvendigt udstyr for automatisering Detekteringsmetoder.
Fysiske målinger på mælk
Henrik Hansen lektor, cand. scient Bioanalytikeruddannelsen, Institut for Teknologi Indsæt dato 1. Vælg Indsæt i topmenuen 2. Vælg Sidehoved og Sidefod.
Selvværd…Hvad er det? NOl-LEOOS HVAD ER SELVVÆRD? Selvværd refererer til en positiv overordnet vurdering af en selv – en oplevelse af at.
Ungdomsliv.
LEVERIKTER OG KVÆG PÅ FUGTIGE AREALER
Ingen binding Alloantigen tilført ved vaccination
KROPPENS FORSVAR.
Dialog mod Vold som business-case
Tilstedeværelsesundervisning
Præsentationens transcript:

Detektion af HIV med hhv Detektion af HIV med hhv. ELISA og GPAT (gelatin partikel agglutinations test) Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Disposition: Teori: Materiale/Metode: Resultater: Diskussion: Retrovirus/Lentivirus ELISA GPAT Materiale/Metode: Kriterier Gennemgang af PubMed søgning Præsentation af artikler Resultater: Resultatskema Diskussion: Konklusion: Statistik i Danmark: Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Problemformulering: ”Hvilken af de to følgende tests, gelatin partikel agglutinationstest (GPAT) eller ELISA, opnår den højeste specificitet, sensitivitet og er mest økonomisk til at påvise HIV antistoffer i blodet?" Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Teori Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

(Human Immunodeficiency Virus) HIV-familie: (Human Immunodeficiency Virus) Retrovirus (-viridae): RNA-virus. Danner revers transcriptase. RNA  DNA. Enzym integrase. DNA integreres i cellens eget DNA. Produktion af nye viruspartikler. ”Skjuler” sig for immunforsvaret. http://www.bioquest.org/bedrock/ problem_spaces/hiv/ Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

HIV-art: Lentivirus: Gruppe af såkaldt kompleks retrovirus. Effektivt til at inficere: Ikke-delende celler Delende celler. HIV udvikler sig hurtigt: Ved at mutere og derved ændre udseende Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

ELISA: (Enzym-Linked Immunosorbent Assay) Bruges til påvisning af antistoffer. Efter 3 måneder Påviser anti-p24 Direkte sandwich Coatning af brønd med primært antistof. Blokering. Prøve tilsættes. Antistofkonjugat tilsættes. Substrat tilsættes. Reaktion stop. Absorbans måles. http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/ BiologyPages/E/Elisa.html Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

GPAT: Binding mellem antigener og antistoffer. Bindes til en partikel (latex). Specifikke antigen-antistofbindinger. Styrken af bindingerne og hastigheden afh. mængden af antistof. Foretages manuelt. Der kan foretages en rensning af serum. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Materiale og metode Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Materiale og metoder: Søgemaskiner: Kriterier: PubMed SweMed+ EMBASE Web of Science Blackwell Synergy Scirus Google scholar Kriterier: Maksimalt 10 år gamle Metodesammenligning mellem GPAT og ELISA eller anden metode Søgning foretaget to gange Søgte efter citerende artikler Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Eks. på søgning i PubMed: Søgeord: ”HIV” Resultater: 109270 poster, 14184 reviews. Handling: Max 10 år gamle. PMID: 14562593 Titel: Validation of a simple … Forfatter: Mashange et al, 2003 Søgeord: ”HIV and ELISA” Resultater: 2406 poster, 72 reviews. Handling: Max 10 år gamle. Søgeord: ”HIV and ELISA and GPAT” Resultater: 1 post. Handling: Max 10 år gamle. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Hele søgningen i PubMed: Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Præsentation af artikler: Metode sammenligninger: Mashange et al: GPAT vs. ELISA Poljak et al: GPAT vs. EIA og Western Blot Huang et al: GPAT vs. ELISA og Western Blot Hong et al: Fortynding af GPAT vs. ufortyndet GPAT Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Præsentation af artikler: Andre artikler: Frank et al: HIV-hjemmetest i USA. Goodstein, J: HIV-hjemmetest i Danmark. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Resultater Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Metode: Mashange et al: Partiklerne er coatede med HIV-1 Ag 5 ml blod opsamles Prøverne blandes Aflæses dagen efter Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Metode: Poljak et al: 3 forskellige coatninger Prøverne tilblandes partiklerne i 3 brønde Aflæses efter 2 timer Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Metode: Huang et al: Partiklerne er coatede med HIV-1 Ag Tilsæt 20 µl af prøve Fortynd 2-fold Aflæses efter 2 timer Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Metode: Hong et al: Modificering (S/LS) Forskellige fortyndinger anvendt Partiklerne coatede med HIV-1 Ag Forskellige kriterier for hvert forsøg Kontrol på positive prøver Aflæses efter 6-48 timer Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Resultater: Antal forsøg (n) Specificitet Sensitivitet Mashange et al 379 99,2 % 100 % Poljak et al 3311 99,97 % Huang et al 565 GPAT: 95,0 % ELISA: 21,6 % 99,5 % Hong et al 309 PA-LS : ? PA-S: 98,8 % PA-LS: 97.0 % PA-S: 100 % Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Diskussion Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Poljak et al vs. Mashange et al: Hvorfor mindre usikkerhed på Poljak et al resultater i forholdet i Mashange et al? Antal prøver Poljak et al 3311 Antal prøver Mashange et al 379 Poljak et al 1 falsk positivt resultat Mashange et al 2 falsk positive resultater Poljak et al specificitet 99,97 % Mashange et al specificitet 99,2 % Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Huang et al vs. Poljak et al: Forskellen mellem Huang et al vs. Poljak et al: Huang et al fik i GPAT 10 falsk positive resultater Poljak et al kun 1 falsk positivt resultat Årsagen er ulemper ved GPAT Huang et al specificitet 95,0 % i GPAT (antal prøver 565) Poljak et al specificitet 99,97 % i GPAT (antal prøver 3311) Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Huang et al vs. Poljak et al: Huang et al fik i GPAT 1 falsk negativt resultat Poljak et al fik 0 falsk negative resultater Årsagen er ulemper ved GPAT Huang et al sensitivitet 99,5 % GPAT Poljak et al sensitivitet 100 % GPAT Huang et al specificitet 21,6 % i ELISA Høj-risiko gruppen Årsagen kan være ELISA’s affinitet Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Mashange et al vs. Huang et al: Forskellen i Mashange et al og Huang et al resultater skyldes de tidligere nævnte årsager: • Antal prøver (Mashange 379, Huang 565) • Falsk positive og falsk negative resultater Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Konklusion: GPAT er ligeså sensitiv som ELISA. Vi kan ikke sige om GPAT er ligeså specifik som ELISA. GPAT er billigere end ELISA. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Statistik i Danmark: Pris for ELISA: ca. 150.000 prøver gange ca. 300 kr. = 45.000.000 kr. Pris for GPAT: ca. 150.000 prøver gange ca. 20 kr. = 3.000.000 kr. Besparelse ved GPAT: 42.000.000 kr. www.ssi.dk Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.

Camilla H. , Thomas L. , Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.