1 第三节 肽 一、肽的结构 二、生物活性肽. 2 肽 肽是氨基酸的线性聚合物。 肽的获得 氨基酸缩合而形成 蛋白质水解产生.

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1 第三节 肽 一、肽的结构 二、生物活性肽

2 肽 肽是氨基酸的线性聚合物。 肽的获得 氨基酸缩合而形成 蛋白质水解产生

3 一. 肽的结构 氨基酸顺序与命名 氨基酸残基 / 寡肽与多肽 / 环肽 N 端 C 端

4 1. 肽键的特点 具有部分双键特性,不能 自由旋转。 肽键的亚氨基没有明显的 解离和质子化。 除脯氨酸外多以反式结构 存在。..

5 肽平面、肽单位、二面角

6 注意  在开链肽的 N 端和 C 端可以有游离的 α 氨基和 α 羧基,而有的开链肽的 N 端或 C 端的游离的 α 氨基或 α 羧基可被别的基团结合(如烷基化、 酰化等)或 N 端残基自身环化(如:谷氨酸)。  脯氨酸在 N 端没有游离的 α 氨基。

7 多肽中的二硫键 22 二硫键

8 2. 肽与氨基酸的离子化程度 肽的酸碱性质--决定于末端 α- 氨基和 α- 羧基及 R 基 它们的解离常数与游离氨基酸中的不同。 N 端 C 端

9 天然存在的重要多肽  以蛋白质形式存在 : 相对分子质量在 6000 以上的多肽称为蛋白质。  以天然活性肽形式存在: ①分子量比较小的多肽以游离状态存在。通常都具有 特殊的生理功能,常称为活性肽。 ②在天然活性肽中含有非蛋白质氨基酸和肽键。

10 二、生物活性肽 (Natural peptide) 脑啡肽;激素类多肽;抗生素类多肽;谷胱甘肽; 蛇毒多肽等

11 1. 谷胱甘肽: γ- 谷氨酰半胱氨酰甘氨酸 COOH CHNH 2 CH 2 CO NH - CH - CO - NH - CH 2 - COOH γ α 还原型谷胱甘肽 GSH CH 2 SH γ Glu - Cys - Gly S S 氧化型谷胱甘肽 GSSG

12 谷胱甘肽重要的生物功能  在体内氧化还原过程中起重要的作用。  作为抗氧化剂维护蛋白质活性中心的巯基游离。  参与二硫化合物相互转化。  GSH :在红细胞中作为巯基缓冲剂存在,维持血红蛋白 和其他红细胞蛋白质的半胱氨酸残基处于还原态。  作为药物治疗肝病

13 2. 神经肽 主要存在于中枢神经系统的一类活性肽。 主要包括: 吗啡样肽 P -物质( 11 肽 )

14 ①脑啡肽(五肽) Leu- 脑啡肽和 Met- 脑啡肽。 + H 3 N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO - + H 3 N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO - 前体物:前脑啡肽原(含 267 个残基)

15 ②内啡肽 包括 α -内啡肽( 16 肽) β -内啡肽( 31 肽) γ -内啡肽( 17 肽) 前体物:促黑素促皮质激素原

16 3. 抗菌肽 抗菌肽 : 一类具有很强抗菌能力的肽. 抗生素 : 由特定微生物产生. 是一类抑制细菌和其他微生物 生长或繁殖的物质. 针对引起炎症的微生物,是杀灭微生 物的. 抗菌药 : 主要是杀灭细菌的。

17 ①青霉素 氨基酸的二肽衍生物。 作用机理:破坏细菌细胞壁糖肽的合成。

18 ②短杆菌肽( 10 肽) 抗菌机理:改变细胞质膜的通透性,以至破坏膜的双层 结构,使胞内物质外漏而致细胞死亡。并且对人和动物 细胞膜起同样作用,故临床使用受到很大限制。

19 ③放线菌素 放线菌素一种从土壤细菌中提取的红色的,通常是有毒 的多肽抗生素。 作用机理:抑制 RNA 的合成,作用于 mRNA 干扰细胞 的转录过程。

20 其它活性肽

21 肽的应用及发展 近年来,多肽的分离纯化、结构分析、化学合成、生物、 放射免疫测定、免疫细胞化学以及遗传工程等新技术的 应用,新的活性肽不断发现,对活性肽功能认识不断增 长,促使这一领域迅速发展

22 第四节 蛋白质的分子结构 一、蛋白质的一级结构 二、蛋白质的空间结构 三、蛋白质的结构与功能的统一性

23 蛋白质结构的不同组织层次( 20 世纪 50 年代) 结构组织层次:一、二、三、四级结构。 介于二和三级结构之间:超二级结构和结构域

24 一、蛋白质的一级结构 (平面结构、化学结构、共价结构 ) 1. 概念:指肽链中的氨基酸顺序。(维持键--肽键) 是蛋白质空间结构和生理功能的基础。 N 端 C 端

25 2. 一级结构的测定(测序) 步骤 测定蛋白质分子中多肽链的数目 拆分蛋白质分子的多肽链和二硫键 分析每一多肽链的氨基酸组成 测定多肽链的氨基酸序列 确定肽段在多肽链中的次序 确定原多肽链中二硫键的位置

26 第一步:测定蛋白质分子中多肽链的数目 测定末端基( C 端或 N 端),看蛋白质的摩尔数与末端 基的摩尔数的比例? 若 1 : 1 ? 1 : 2 ? 1 : 3 ?

27 第二步:拆分蛋白质分子的多肽链和二硫键 借助非共价相互作用缔合的 采用变性剂: 8mol/L 尿素; 6mol/L 盐酸胍; SDS 处理。 通过共价二硫桥(- S - S -)交联的肽链 采用氧化剂或还原剂:将二硫键断裂。 分离、纯化多肽链:电泳、层析等方法。 猪

28 ①还原法:二硫键的断裂 使用的还原剂有:  巯基乙醇(  - 巯基乙醇 H0 - CH 2 CH 2 - SH )、  巯基乙酸、  二硫苏糖醇( DTT )

29 为防止巯基重新氧化,可用碘乙酸、碘乙酰胺等使 其烷化

30 ②氧化法:二硫键的断裂 二硫键用过甲酸氧化为磺酸基而拆开

31 第三步:分析每一多肽链的氨基酸组成 待测样品经酸 (6mol/L HCl) 和碱 (5mol/L NaOH) 完全水解。 用氨基酸分析仪进行测定(强阳离子交换)。测定水解 液中的氨基酸组成和比例,氨量。

32

33 练习题 常用来打开二硫键的试剂有 __ 和 __ 。 我国于 ____ 年在世界上首次合成了具有生物活性的蛋白质 结晶牛胰岛素。 在一些天然肽中含有 __ 、和 _ 等特殊结构。这些结构在蛋 白质中是不存在的。很可能这些结构上的变化可使这些肽 免受蛋白水解酶的作用。 Sanger 试剂是 A. 苯异硫氰酸 ((PITC 法 ) B.2 , 4- 二硝基氟苯 (FDNB 法 ) C. 丹磺酰氯 (DNS-Cl 法 ) D. β- 巯基乙醇 谷胱苷肽结构特点及生物功能?

34 一级结构的测定(测序) 步骤 测定蛋白质分子中多肽链的数目 拆分蛋白质分子的多肽链和二硫键 分析每一多肽链的氨基酸组成 测定多肽链的氨基酸序列 确定肽段在多肽链中的次序 确定原多肽链中二硫键的位置

35 第四步:测定多肽链的氨基酸序列 N -末端氨基酸测定 C -末端分析 多肽链的部分裂解和肽段混合物的 分离纯化 NH 2 COOH

36 ( 1 )肽链末端分析 N- 末端分析 C- 末端分析 N 端 C 端

37 ① N- 末端分析 二硝基氟苯法( FDNB 法) 二甲基氨基萘磺酰氯法( DNS-Cl 法) 异硫氰酸苯酯法( Edman 法) 氨肽酶法

38 2,4 -二硝基氟苯法 ( Sanger 试剂, DNFB 或 FDNB )  1945 年由 Sanger 发明此法,曾用此方 法经 10 年测定了牛胰 岛素的的一级结构。 单肽链+ FDNB DNP -肽链(黄色) DNP -( N 端)氨基酸 + n 个氨基酸 弱碱 6mol 盐酸中 乙醚抽提后层析,与标准 DNP -氨基 酸比较,确定 N 端氨基酸?

39 苯异硫氰酸酯( PITC 、 Edman 法) 特点:是能够不断重复循环,将肽链 N- 端氨基酸 残基逐一进行标记和解离。  一次可以连续测出 80 个左右的残基顺序。大的肽 链测序前要化大为小,不能采用全水解。  氨基酸序列自动分析仪是以此法为原理设计的。

40 单肽链+ PITC PTC -肽链(黄色) PTH -( N 端,环化)氨基酸 + 余下少一个氨基酸的肽链 弱碱 乙醚抽提后层析,与标准 PTH -氨基 酸比较,确定 N 端氨基酸? 硝基甲烷中,加酸,加热

41

42 二甲基氨基萘磺酰氯法( DNS-Cl 法) 1956 年 hartley 等提出 灵敏度较高(比 FDNB 法提高 100 倍),样品量小于 1 毫微摩尔, DNS- 氨基酸稳定性较高。

43 氨肽酶法:从 N 端依次切断肽键 氨肽酶是一类肽链外切酶( exopeptidases H 2 NVal - His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu - Lys COOH

44 ② C -末端分析 肼解法 羧肽酶法

45 肼解法 无冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸被破坏不易测定出。 无水加热 -

46 羧肽酶法 根据氨基酸释放的动力学曲线, 可确定该肽链的 C 端氨基酸顺序。 (C- 末端第二个是 Pro 时不 作用) NH 2 COOH 主要方法 t Phe Glu Leu

47 ③多肽链部分裂解和肽段混合物的分离纯化 要求:选用专一性强的、断裂点少的、反应产率高的蛋白水 解酶或化学试剂进行有控制的裂解。后将所得混合物进行分 离纯化。经 N 未端和 C 未端测定,确定出每一肽段的序列。 选用 A 选用 B

48 酶解法 (表现出专一性) 酶 专一性抑制水解 胰蛋白酶 糜蛋白酶(胰凝 乳蛋白酶) R 1 =赖或精侧链, AECys R 1 =苯丙、酪、色;亮、蛋、组 R 2 =脯

49 R1= 赖氨酸 Lys 或精氨酸 Arg 侧链(专一性较强,水解 速度快) 水解位点

50 或胰凝乳蛋白酶: R1= 苯丙氨酸 Phe, 色 氨酸 Trp, 酪氨酸 Tyr; 亮氨酸 Leu ,蛋氨酸 Met 和组氨酸 His 水解 稍慢 水解位点

51 Pepsin : R1 为苯丙 氨酸 Phe, 色氨酸 Trp, 酪氨酸 Tyr 或谷氨酸 Glu ,天门东氨酸 Asp; 亮氨酸 Leu 以及 其它疏水性氨基酸水 解速度较慢 水解位点

52 thermolysin : R2= 苯丙氨酸 Phe, 色氨酸 Trp, 酪氨 酸 Tyr; 亮氨酸 Leu ,异亮氨酸 Ileu, 蛋氨酸 Met 以及 其它疏水性强的氨基酸水解速度较快 水解位点

53 化学法  溴化氰水解法 (CNBr): 切割 Met 的羧基所形成的肽键。  用羟胺断裂 : 它断裂- Asn-Gly-, 但专一性不高。

54

55 第五步:确定肽段在多肽链中的次序 所得资料: N -末端残基 H C -末端残基 S 第一套肽段 OUS PS EOVE RLA HOWT 第二套肽段 SEO WTOU VERL APS HO 借助重叠肽确定肽段次序: HOWT OUS EOVERLAPS

56 第六步:确定原多肽链中二硫键的位置 采用胃蛋白酶:专一性低,切点多。肽段比较小,分离、 鉴定比较容易。作用 pH 在酸性范围。 肽段混合物进行的对角线电泳

57 对角线电泳 暴露在过 甲酸蒸气 中使二硫 键断裂 + +

58 巯基的保护

59 酰胺基位置的确定 用酸处理含酰胺基的肽链,使其产生游离的 NH 3 和- COOH 。 测出 NH3 的数量和可能形成的- COOH 的数量(不包括 C 端), 如两者相等,就可以确定酰胺基的位置

60 (胰岛 β -细胞产生,图 4 - 3 58 页) 牛胰岛素的一级结构 (胰岛 β -细胞产生,图 4 - 3 58 页) 主要功能 : 是降低体内血糖含量。 1953 年 F.Sanger 等测定出了牛胰岛 素的氨基酸顺序。每种蛋白质都具 有特异而严格的氨基酸种类、数量 和排列顺序的一级结构。 1965 年 9 月,中国科学院生物化学 研究所、有机化学研究所和北京大 学化学系协作,在世界上第一次人 工合成了结晶牛胰岛素。 猪

61 S S S S S S A NH 2 B NH COOH 21 肽 30 肽

62 例:有一个 A 肽? ①酸水解得到: Ala 、 Arg 、 Ser 、 Glu 、 Phe 、 Met ; ②当 A 肽与 FDNB 试剂反应后得: DNP-Ala ; ③当 A 肽用 CNBr 降解时得到:游离的 Ser 和一种肽 ; ④当 A 肽用胰蛋白酶降解时得到两种肽: 一种含 Ala 、 Arg , 另一种含其它氨基酸 ⑤当 A 肽用糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶)降解时得到两种肽: 一种含 Met 、 Ser , 另一种含其它氨基酸; 问 A 肽的氨基酸排列顺序如何? 答: Ala - Arg - Glu - phe - Met - Ser

63 思考题 肽键及肽键的特点 天然生物活性肽及结构特点 谷胱苷肽结构特点及生物功能、抗菌肽 蛋白质一级结构及序列测定步骤