Nye Nordiske avlsværdital Gert Pedersen Aamand, Jørn Pedersen, Ane Closter og Anders Fogh Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri.

Slides:



Advertisements
Lignende præsentationer
Præsentation af resultater for projekt ”Analyse af samarbejdet mellem kommunerne og Region Midtjylland, Jord og Råstoffer” Jord-ERFA-Midt,
Advertisements

VMS data Geografisk og tidsmæssig udvikling af indsatsen i tobisfiskeriet v/ dataspecialist Josefine Egekvist Sekretariat for myndighedsbetjening.
Atomer Et programmeret forløb. En måde at lære på.
UU-Aalborg Evaluering af brobygning og intro 2013/14 Velkommen UU-Aalborg Ungdommens Uddannelsesvejledning.
Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk testdagsmodel for ydelse Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Chefkonsulent Leif Knudsen Videncentret for Landbrug Naturerhverv.dk
Nyt fra I NTERBULL og fremtidige udviklingsopgaver Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
1 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Overgang til testdagsmodel Tyrenes ændringer i avlsværdital for ydelse Anders Fogh Afdeling for Specialviden.
Avlsværdital for ungdyrdødelighed Line Hjortø Buch.
Nordisk Avlsværdivurdering Derfor skal vi have nye metoder i avlsværdivurderingen! Hvad sker der på nordisk og internationalt plan? Ved direktør Gert Pedersen.
1 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Overgang til testdagsmodel Anvendelse af data i testdagsmodellen Anders Fogh Afdeling for Specialviden.
Nordisk Avlsværdi Vurdering • Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk avlsværdivurdering for køer Klovsundhed for genomisk testede tyre August 2012 Anders.
v/ Professor Lars Ehlers, Aalborg Universitet
InSire.
Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk testdagsmodel for ydelse Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Bolig selskabernes Landsforening– Almene lejeboliger - Maj/Juni Almene lejeboliger - Danmarkspanelet - Maj/Juni 2010.
Nordisk Avlsværdi Vurdering • Nordic Cattle Genetic Evaluation Blendede avlsværdital hos køer Jørn Pedersen Ulrik S. Nielsen, Gert P. Aamand, Anders Fogh,
Økonomi i anvendelse af GS, KSS og kødkvæg
Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Nordisk Avlsværdivurdering Dansk Kvæg ”Teknikken” i testdagsmodellen(1) Jørn Pedersen Dansk Kvæg, Afdeling for.
Kend dine maskinomkostninger
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Procedurer for rettelse af afstamning på genotypede dyr Kevin Byskov og Anders Fogh.
Praktiske overvejelser ved brug af Genvikplustyre Informationsmøde om avl 12. oktober 2010 Morten Kargo.
Anders Fogh Mette Sandholm
Lektion 6: Kvantitative egenskaber, avlsværdi og heritabilitet
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Erfaringer med genomiske avlsværdital Informationsmøde 9. oktober 2012 Ulrik Sander Nielsen.
Fra registrering til indeks, samt betydningen af valg af avlstyr
Region Midtjyllands tilbud 2013
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nyt om eksteriør- og fremtidige muligheder Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik Sander Nielsen,
Informationsmøde Den 9. oktober 2012 Anders Fogh Information til besætningsejere, som tester hundyr.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nyt fra NAV Gert Pedersen Aamand.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Udviklingsopgaver og nyt fra Interbull Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Beregningsprocedure og offentliggørelse af avlsværdital Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Nye genetiske parametre for ydelse Anders Fogh og Kevin Byskov.
Hvad betyder rækkeafstanden ved såning af græs til slæt og afgræsning?
Typiske mismatch-sager Kevin Byskov STØTTET AF mælkeafgiftsfonden Videncentret for Landbrug
v/direktør Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering
Matematik B 1.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nyt fra Interbull og NAV udviklingsaktiviteter Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Avlsmæssig anvendelse og resultater hos tyre Anders Fogh Informationsmøde 2011.
Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh
Grunde til at jeg elsker dig
Danske klovdata Kevin Byskov og Pia Nielsen. Disposition Antal klovbeskæringer i Danmark, Sverige og Finland Hvad viser de danske registreringer Inden.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Andre aspekter af genomisk selektion Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Klovproblemer Hvilke avlsmæssige tiltag kan vi gøre? Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Fundamentale datastrukturer
Nordisk Avlsværdivurdering Maj 2005 NAV. Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk avlsværdivurdering Hvem, hvad og hvorfor NAV.
Avlsplaner med eller uden genomisk selektion og afkomsundersøgelse L.H. Buch, M.K. Sørensen, P. Berg, L.D. Pedersen og A.C. Sørensen.
Baggrund: Vanskeligt at forudsige perioder med en lav risiko for angreb af kartoffelskimmel tilstrækkeligt sikkert Prognosen for RH (skimmelvejr) ikke.
Optimer dyrkningen af hybridrug
1 Fundamentale datastrukturer. 2 Definitioner: abstrakt datatype, datastruktur Elementære datastrukturer og abstrakte datatyper : arrays, stakke, køer,
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Informationsmøde 2014 NAV avlsværdital for ungdyroverlevelse Jørn Pedersen, Jukka Pösö, Jan-Åke.
Anders Fogh og Mette Sandholm
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Avlsmål i Norden Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen.
Internationale avlsværdital på unge tyre Gert Pedersen Aamand, Ulrik Sander Nielsen og Anders Fogh STØTTET AF mælkeafgiftsfonden Videncentret for Landbrug.
Resultater fra ukrudtsbekæmpelse i 2014
Avlsmæssig anvendelse og resultater hos hundyr Anders Fogh Informationsmøde 2011.
NAV avlsværdital for yversundhed Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Nyt fra Interbull Gert Pedersen Aamand og Ulrik Sander Nielsen Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Den Europæriske Landbrugsfond.
Beregning af GEBV ud fra DGV og fænotypiske registreringer (blending) Jørn Pedersen Ulrik S. Nielsen Gert P Aamand Anders Fogh.
Kontrol af indberettede afstamningsoplysninger Delprojekt af Brugbare Data Kevin Byskov, Jørn Pedersen og Anders Fogh.
Fra SNP til DGV Ulrik Sander Nielsen og Anders Fogh Informationsmøde 29. september 2011.
Status på udtagning af vævsprøver Anders Fogh Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Den Europæriske Landbrugsfond for Udvikling.
Imputation Kevin Byskov og Line Hjortø Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Den Europæriske Landbrugsfond for Udvikling af Landdistrikterne.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk prediktion Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik S. Nielsen Jørn Pedersen, Anders.
Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Den Europæiske Landbrugsfond for Udvikling af Landdistrikterne Danmark og EU investerer.
Velkommen til Lægaard UC-Holstebro
Informationsmøde 2014 NAV avlsværdital for ungdyroverlevelse
Præsentationens transcript:

Nye Nordiske avlsværdital Gert Pedersen Aamand, Jørn Pedersen, Ane Closter og Anders Fogh Naturerhverv.dk Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Den Europæriske Landbrugsfond for Udvikling af Landdistrikterne Danmark og EU investerer i landdistrikterne. STØTTET AF mælkeafgiftsfonden Link til: European Agricultural Fund for Rural Development Videncentret for Landbrug

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Arbejde for at opnå bedre traditionel avlsværdivurdering Ungdyrdødelighed (Jørn) Malketid (Ane og Anders) Eksteriør Ydelse Mastitis Frugtbarhed Yvereksteriør – robot data

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation NAV avlsværdital for Ungdyrdødelighed (Kalveoverlevelse) Analyse på danske data af Line Hjortø (Tidligere: Morten Hansen, Elise Norberg) Genetiske parametre Lav heritabilitet: 0,5% - 3,5% Høj korrelation mellem kvie- og tyrekalves resultater (> 0,9) Middel korrelation mellem tidlig og sen overlevelse (0,4-0,6) Store datamængder er til rådighed i databasen Konklusion: Kalveoverlevelse kan forbedres genetisk NAV har besluttet at udvikle indeks for kalveoverlevelse ( Tilsvarende hollandsk avlsværdital er ”på trapperne”)

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation 4 egenskaber – 4 avlsværdital Kviekalve periode 1 (HP1): Overlevelse i perioden 1-30 dage Kviekalve periode 2 (HP2): Overlevelse i perioden dage Tyrekalve periode1 (BP1): Overlevelse i perioden 1-30 dage Tyrekalve periode 2 (BP2): Overlevelse i perioden dage Sammenvejes til et samlet indeks for kalveoverlevelse 4

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Eksempel: 2 afkomsgrupper Tyr 1Tyr 2 Antal%overlevetAntal%overlevet HP ,7%344297,9% HP ,7%219698,5% BP ,5%210697,2% BP ,2%200797,1%

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Data, som udelades Dødfødte (Aborterede kalve og defekte kalve) Kalve som aflives efter fødsel Kalve født ved flerfødsler (tvillinger, trillinger) ET-kalve, kastrater/stude Manglende information (f.eks. overlevelse, besætning, fødselsdato køn, kælvningsnummer) Racen ikke: RDC, HOL, JER, RED eller FIC

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Data KviekalveTyrekalve Periode d Periode d Periode d Periode d Antal kalve DNK (1998 – 2012) FIN (2004 – 2012) SWE (1999 – 2012) Procent overlevet DNK (1998 – 2012) 95,90%95,72%94,78%94,.88% FIN (2004 – 2012) 98,49%97,71%98,21%96,42% SWE (1999 – 2012) 98,12%95,02%

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Model Beregnes i en multi-trait Animal Model Effekter: Besætning x år (tilfældig) Besætning x 5-år Land x år x fødselsmåned Land x kælvningsnummer (1. eller senere) Land x flytning (kun periode 2) Heterosis

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Status Genetiske parametre: Analyseret af Line Hjortø Procedure til editering af data: Er udviklet Model er udviklet (næsten) Model validering (Interbull test anvendes) – er ikke gennemført Mål publicering Februar 2014

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Avlsværdivurdering af malketid – rutine model 1. laktationsinformationer: Bedømmelse fra spørgeskema (skala 1-9) (DK; SE og FI) TruTest målere (DK) Flow udtrykt som liter / minut Antager flow og bedømmelse er samme egenskab Standardisere så genetisk spredning er ens Gns af flow dag efter kælvning

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Fast installeret mælkeflowsmåler Mælkeflow registreres på faste mælkemålere Malkerobotter Traditionelle malkesystemer Mange af disse data overføres i dag til kvægdatabaserne i DK, SE og FI Større sikkerhed på avlsværdital for malketid for både køer og tyre hvis alle flow data udnyttes

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nuværende måleudstyr i Danmark, HOL Danmark Samtlige 1st laktationskøer TruTest målere (EMM målere) 54% Bedømmelse skala 1-914%

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nye malketids målinger i Danmark, HOL FabrikatProcent af samtlige 1st køerRutine evaluering TruTest (samtlige målertyper)56% √ BouMatic1% √ DairyMast0,3% √ DeLaval AMS11% - DeLaval7% √ Fullwood0,3% - Lely11 – 13 % √ SAC3% √ SACGalaxy / SACRDSFu AMS0,2% - Strangko2% - Westfalia3% -

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nye malketidsmålinger i Finland og Sverige, HOL FinlandAntal 1st laktationskøer 2012 TruTest målere631 DeLaval24 SverigeAntal 1st laktationskøer 2012 AMS6.207 Andre mælkeflowsmålere6.829

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Udfordringerne til at medtage data fra forskelligt måleudstyr Sikre data kvalitet og dermed arvbarhed er ens og det er samme egenskab der udtrykkes Standardisere så den genetiske variation af data fra forskelligt udstyr er ens

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Igangværende arbejde flow fra stationær malkeudstyr Editering af data (afsluttet) Standardisering af data Testkørsel –avlsværdivurdering af malketid inkl nye data Validering af resultater Rutine evaluering Februar 2014

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Malketid i insemineringsplanen Nu: Kvægbrugerens bedømmelse af malketid Fremover: Editering af malketidsdata - TruTest og nye - til avlsværdivurdering (>85% af køer) Dannelse af datasæt med input til ins. plan – afvigelse fra bes. gns.

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Malketid i insemineringsplanen konsekvenser Indvirkning på tyrevalg før koen insemineres i 1. laktation Indvirkning i besætninger som ikke bliver besætningsbedømt Udfasning af kvægbrugerens vurdering af malketid Dog muligt at bibeholde hvis kvægbruger ønsker!

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Forbedret avlsværdivurdering for eksteriør Nuværende evaluering startede i Harmonisering af systematiske effekter 2.Håndtering af senere laktationer – genetisk korrelation (ønske fra især RDC) 3.Fleregenskabs evaluering (Multi trait) indenfor en gruppe af egenskaber eg. malkeorganer Forventet rutine feb 2014

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Data -total antal køer - i tusinde RaceLaktationHolsteinRDCJersey Danmark Finland Sverige

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Hvad er analyseret? RDC, Holstein, Jersey Malkeorganer 10 egenskaber i 3 laktationer = 30 egenskaber 435 genetiske korrelatioener+30 arvbarheder Lemmer 5 egenskaber i 3 laktationer =15 egenskaber 105 genetiske korrelatioener+15 arvbarheder Krop 7 egenskaber I 3 laktationer= 21 egenskaber 189 genetiske korrelatioener+21 arvbarheder

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genetiske parametre Egenskabs gruppe ArvbarhedHøjeste Krop0,30Højde=0,6 Lemmer0,20- Malkeorganer0,25Yverdybde=0,40 Genetisk korrelationer mellem laktationer 0,87-0,99 Miljømæssig korrelation mellem laktationer 0,10 – 0,60

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Korrelation mellem laktationer RaceEgenskabsgruppeGenetisk korrelation HolsteinKrop0,91 - 0,99 RDC0,92 - 0,99 Jersey0,92 - 0,99 HolsteinLemmer0,97 - 0,99 RDC0,96 - 0,99 Jersey0,94 - 0,99 HolsteinMalkeorganer0,88 - 0,99 RDC0,91 - 0,99 Jersey0,91 - 0,99

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genetisk korrelation indenfor laktation EgenskabsgruppeGenetisk korrelation Krop 0,33 - 0,91 Lemmer-0,18 - 0,37 Malkeorganer-0,13 – 0,70

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Sammenhæng mellem avlsværdital fra ny model og nuværende, tyre KropLemmerMalkeorganer Holstein0,960,97 RDC0,96 0,97 Jersey0,95 0,96 Nuværende avlsværdital er baseret på 1. laktation alene - den høje korrelation mellem laktationer gør at korrelationen mellem avlsværdital er ret høj

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Sammenhæng mellem avlsværdital fra ny model og nuværende, køer KropLemmerMalkeorganer Holstein0,.940,97 RDC0,96 0,97 Jersey0,95 Nuværende avlsværdital er baseret på 1 – 3. laktation. Korrelation mellem egenskaber er ny information der udnyttes

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Hvad mangler? Afklare om den endelig model skal udnytte alle korrelationer eller alene korrelationer mellem laktationer (giver nogle beregningsmæssige udfordringer pt) Foretage de endelige validerings beregninger i relation til Interbull

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Videreudvikling - yverkoordinater Anvende yverkoordinater i eksteriørevaluering Høje arvbarheder AMS> inspektørbedømmelser Høje genetiske korrelationer Egenskabh 2 - AMS h 2 – Insp rgrg Forpatteplacering0,46 0,31 0,92 Bagpatteplacering0,38 0,32 0,94 Afstand, for - bag0, Yverbalance0,44 0,22 0,90 Yverdybde0,65 0,42 0,94

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Opdatering af ydelses model Indført Feb 2012: Nye genetiske parametre Harmonisering af modeller Forbedring af heterogen varians korrektion Indføres 2. Nov 2013 Bedre håndtering af NRF raceandele hos RDC Stor fokus i Sverige og Finland

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Opdatering af ydelses model (i gang) Bedre outlier test Bedre håndtering af meget afvigende ydelsesresultater Bedre håndtering af data fra robotter i HV korrektion Anden variation i fedt, protein og mælkemængde Krydsningsmodeller Samtid evaluering af Holstein, RDC og Jersey Anvendelse på krydsningsdyr og evt også alle renracede men skal ses i sammenhæng med one step udfordringer

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Frugtbarhed (start efterår 2013) Nuværende model fra 2005 Mulige forbedringer Animal Model i stedet for sire model Laktationer betragtes som forskellige egenskaber i stedet for som den samme egenskab Evt hensyntagen til stærk ydelsesselektion Europæisk harmonisering – ”conception rate” i stedet for IO56

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Yversundhed – nye SCC parametre 2010 – Holstein parametre anvendt for SCC hos RDC og Jersey 2011/12 – RDC og Jersey parametre beregnet for SCC 2013 IB test med anvendelse af nye parametre Implementeres i 2014 mindre effekt

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation NTM og delegenskaber – justeringer Maj 2013 Y-indeks – Holstein og DRH NTM vægte Holstein, Jersey og RDC November 2013 Krop – Jersey Malkeorganer - RDC

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Krop og malkeorganer 2. November 2013 Jersey - Krop: Optimum for malkepræg ændret fra 7 to 6 RDC - Malkeorganer: Vægt på forpatteplacering øget fra 7 til10 Vægt på bagpatteplacering reduceret fra 8 til 5 Vægt på pattelængde øget fra 5 til 10, Vægt på pattetykkelse øges fra 5 to 10 Vægt på yverbalance reduceres fra 10 til 0.

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Andre fælles nordiske aktiviteter der er sat i drift Fælles præsentation af genetiske trend (link nordiske trendkurver fra VFL|kvægs eller NAVs ( hjemmesiderhttp:// Fælles søge database for Interbull avlsværdital (link søgning på tyre med Interbull indekser fra hjemmeside) Fælles inspektør statistikker (styrke harmonisering) Fælles søge database for NAV avlsværdital er beskrevet – overslag over programmering under udarbejdelse

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Fælles Nordisk søgeside med NAV-tal Fælles beskrivelse udarbejdet Programmering i Finland før jul Mål - fælles søgeside klar starten af 2014

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Sammenfatning Ungdyrdødelighed - første rutine feb 2014 Malketid – flere data feb 2014 Eksteriør – ændret vægte nov 2013,ny model feb 2014, robot data Ydelse – outlier og AMS håndtering feb 2014 Mastitis – nye parametre RDC og Jersey Frugtbarhed – bedre model Fælles søgeside NAV tal