Egenskaber ved sorter af vårbyg til økologisk dyrkning – BAR-OF Molekylære markører Sortsforsøg Sortsblandinger Næringsstofoptagelse Sygdomskomplekser Ukrudt Matematik og statistik
Egenskaber ved sorter af vårbyg til økologisk dyrkning – BAR-OF Molekylære markører Sortsforsøg Sortsblandinger Næringsstofoptagelse Sygdomskomplekser Ukrudt Matematik og statistik
Hvorfor DNA markører i BAR-OF? Til at beskrive genetisk diversitet mellem linierne/sorterne Til at sammenligne molekylære markører og morfologiske egenskaber til sortsbestemmelse Til at beskrive forandringer i sammensætning af sortsblandinger gennem forsøgstidsrummet Til at lokalisere gener for egenskaber med betydning i økologisk landbrug på kromosomfragmenter
Hvilke DNA markører bliver brugt? Mikrosatelliter = SSR (Simple Sequence Repeats) TGTGGGGCCACAAAACGTATAGATCAAAGTAATAATAATATTGATTAAATG ATATATATATATATATATATATATATATATATATAT CTAGAAGTTGTAGAAGACTAGCTAGAACGTACG Eksempel:
Detektering af polymorfier AC n
Fordeling af markørgrupper 96 linier med 75 mikrosatelliter
Genetisk distance MDS baseret på 96 byg-linier og 75 mikrosatelliter
Genetisk distance MDS baseret på 96 byg-linier og 75 mikrosatelliter
Sammenligning med afstand fra morfologiske egenskaber
Brug af data i andre sammenhænge
Eco-TILLING procedure DNA isolation Pooling Genspecifikke primer (2 forskellige farver) PCR reaktion Denaturering Renaturering Tst + Std Std Standard (Std) Tester (Tst) + CEL I
Diskrimination af Mla-alleler gennem Eco-TILLING
Stamtavle af Adonis med mlo mlo9mlo11