Lektion 12: Bio- og beregningsteknologi Beregningsteknologi for avlsværdiskøn Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn Transgenese.

Præsentationer af emnet: "Lektion 12: Bio- og beregningsteknologi Beregningsteknologi for avlsværdiskøn Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn Transgenese."— Præsentationens transcript:

1 Lektion 12: Bio- og beregningsteknologi Beregningsteknologi for avlsværdiskøn Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn Transgenese og transgene dyr Anvendelse af DNA-markører for sygdomsgener Påvisning af sygdomsgener eller QTL'er

2 De vigtigste beregningsmetoder for avlsværdiskøn Selektionsindeks (SI) Best Linear Prediction (BLP) Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) Animal Model (AM)

3 Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn Forudsætninger for avlsværdi bestemmelser Standardiserede Miljøforhold Forsøgsstation eller korrektion for miljø KS giver forudsædninger for ligestilling, idet en tyr eller en orne får afkom i mange forskellige besætninger

4 Betydning af kunstig sædoverføring for beregning af avlsværdiskøn Sikker bestemmelse (store familier) Uafhængig af ejerforhold Sammenlignelige Øget selektionsintensitet og sikkerhed r IA ved KS og Superovulation

5 Transgenese og transgene dyr Genkonstrukter Metoder til genoverførsel Produktionsmæssige motiver for transgenese. Andre motiver for transgenese

6 Genkonstrukter Promoter (regulator-sekvenser) Strukturgen (DNA koden for et protein)

7 Mikroinjektion af DNA i hanlig forkerne Embryonale stamceller og homolog rekombination Mikroinjektion eller anden form for genoverførsel i føtale celler Metoder til genoverførsel

8 Motiver for transgenese? Effekt  4  A Nye metabolske egenskaber Lægemidler Organdonation

9 Eksempel på anvendelse af DNA- markører for sygdomsgener DNA-markører (A,B) indenfor familie * = sygdomsgen, + = normalt gen

10 Genomet er ca. 3000 centi Morgan (cM) En markør dækker 20 cM 150 DNA markører kræves til analyse af en given udspaltning Ca. halvdelen af markørene er informative, så der skal anvendes ca. 300 i alt Påvisning af DNA-markør koblet til sygdomsgener eller QTL'er

11 Familiestørrelse ca. 50 til analyse Mindst 10 til 15 syge Bedste forhold mellem syg og rask er 1:1 De overskydende raske udelades tilfældigt Egnet familiemateriale til påvisning af sygdomsgen Genotype syg ikke syg Total aa 20 3 23 ikke aa 4 23 27 Total 24 26 50

12 Familiestørrelse skal være flere tusinde Man ved ikke på forhånd om der er et QTL Der kan anvendes sire eller grand-sire design F 2 dyr i forbindelse med eksotiske krydsninger Egnet familiemateriale til påvisning af QTL’er

13 QTL estimation Grand sire design Effekt måles på afkom avlsværdier Sire design Effekt måles på afkom phenotyper Markør typning sker i begge tilfælde på forældre og afkom Sire design eller Grand-sire design

14 Sire design eller Grand-sire design, grafisk forsøgsdesign

15 Sire design eller Grand-sire design, forsøgsstørrelse Antal A 1 Antal A 2 S.D. LSD for sygdomsfrekvens 5000 5000 0,0060 1,8 % enheder 500 500 0,0190 5,7 % enheder 100 100 0,0420 12,6 % enheder Antal syge  bin(N;0,1  0,9/N) Mindste signifikante forskel (LSD) i sygdomsfrekvens for afkom med A 1 og afkom med A 2