Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Nordisk Avlsværdivurdering Dansk Kvæg ”Teknikken” i testdagsmodellen(1) Jørn Pedersen Dansk Kvæg, Afdeling for.

Slides:



Advertisements
Lignende præsentationer
Automatiseret GUI-test Lars Kjølholm Testnet maj 2009.
Advertisements

KiMs – Maj KiMs SMAGSTEST - franske kartofler - Maj 2012.
Den danske befolknings syn på handicappedes rettigheder
SMUT PAKKE 2 VIDEN OM SUKKERSYGE.
VMS data Geografisk og tidsmæssig udvikling af indsatsen i tobisfiskeriet v/ dataspecialist Josefine Egekvist Sekretariat for myndighedsbetjening.
Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk testdagsmodel for ydelse Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Heatime – hurtig og enkel registrering af brunst
Nyt fra I NTERBULL og fremtidige udviklingsopgaver Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
1 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Overgang til testdagsmodel Tyrenes ændringer i avlsværdital for ydelse Anders Fogh Afdeling for Specialviden.
Nordisk Avlsværdivurdering Derfor skal vi have nye metoder i avlsværdivurderingen! Hvad sker der på nordisk og internationalt plan? Ved direktør Gert Pedersen.
1 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Overgang til testdagsmodel Anvendelse af data i testdagsmodellen Anders Fogh Afdeling for Specialviden.
Nordisk Avlsværdi Vurdering • Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk avlsværdivurdering for køer Klovsundhed for genomisk testede tyre August 2012 Anders.
Indsæt nyt billede: Format: B 254 x 190,5 mm Efter indsættelse, højreklik på billedet og placér det bagerst. Delete det gamle foto Ny Farm N Visning og.
v/ Professor Lars Ehlers, Aalborg Universitet
VTU 2010 | Virksomhedstilfredshedsundersøgelse Københavns Tekniske Skole Inspektørområde - Tæbyvej Svarprocent: 23% (64 besvarelser ud af 274 mulige)
Nordisk Avlsværdivurdering Nordisk testdagsmodel for ydelse Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Bolig selskabernes Landsforening– Almene lejeboliger - Maj/Juni Almene lejeboliger - Danmarkspanelet - Maj/Juni 2010.
Nordisk Avlsværdi Vurdering • Nordic Cattle Genetic Evaluation Blendede avlsværdital hos køer Jørn Pedersen Ulrik S. Nielsen, Gert P. Aamand, Anders Fogh,
Trivselsundersøgelse og ledelsesevaluering
av Lajla Ellingsen og Mari By Rise Adresseavisen
Anders Fogh Mette Sandholm
Statistik.
Naboskabet - en undersøgelse af 3 boligområder 473 beboere besvarede undersøgelsen 6-11 år: år: år: 4 Voksne: 454.
Lektion 6: Kvantitative egenskaber, avlsværdi og heritabilitet
Økonometri 1: Specifikation og dataproblemer1 Økonometri 1 Specifikation, og dataproblemer 4. november 2005.
Opslagsfelter (Access, del 6). RHS – Informationsteknologi 2 Udgangspunkt Vi er ofte i den situation, at valg af en type for et felt ikke begrænser vores.
Økonometri 1: Dummy variable
Signifikanstest ved (en eller) to stikprøver
Start test 1 KLIK HER. Hvilken tast skal du bruge for at redigere en celle direkte? 2 F1 F2 F5 F7.
Indhold Kort om sundhedsprofilen Hvad kan man bruge sundhedsprofilen til? Udvalgte data Hvordan skal den læses? Kommunikationsstrategi 2.
Trivselsundersøgelse og ledelsesevaluering Anæstesiologisk Afdeling Flere ledere
Informationsmøde Den 9. oktober 2012 Anders Fogh Tilgængelighed af oplysninger på Dyreregistreringen.
ETU 2008 | Elevtilfredshedsundersøgelse Erhvervsskolen Nordsjælland HTX (Teknisk Gymnasium) - Hillerød Baseret på 313 besvarelser.
Informationsmøde Den 9. oktober 2012 Anders Fogh Information til besætningsejere, som tester hundyr.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nyt fra NAV Gert Pedersen Aamand.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Udviklingsopgaver og nyt fra Interbull Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Sandsynligheder Udfald og hændelser Sandsynligheder Additionsreglen
AGWAPLAN IDA- møde om Vandrammedirektivet Side 1 · · Life projekt Agwaplan Samarbejde med landbruget om vandplaner med fokus på Ravn Sø Henrik.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Beregningsprocedure og offentliggørelse af avlsværdital Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Globaliseringsredegørelsen 24.mar. 14 Figurer fra Danmark tiltrækker for få udenlandske investeringer i Sådan ligger landet
Testeksperiment EVAluering November 2007 | Henrik Brønnum-HansenSide 1 CEEH Interessentforum 26. november 2007 Henrik Brønnum-Hansen Et testeksperiment.
1 Ændringer i NorFor Plan i forhold til BEDRIFTSLØSNING.
Nye genetiske parametre for ydelse Anders Fogh og Kevin Byskov.
v/direktør Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nyt fra Interbull og NAV udviklingsaktiviteter Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Rapporter (Access, del 5). RHS – Informationsteknologi – Udgangspunkt Vi har oprettet en database Vi har defineret en eller flere tabeller, og.
Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh
Grunde til at jeg elsker dig
Danske klovdata Kevin Byskov og Pia Nielsen. Disposition Antal klovbeskæringer i Danmark, Sverige og Finland Hvad viser de danske registreringer Inden.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Andre aspekter af genomisk selektion Gert Pedersen Aamand og Anders Fogh.
Fundamentale datastrukturer
Opslagsfelter (Access, del 6). RHS – Informationsteknologi – Udgangspunkt Vi er ofte i den situation, at valg af en type for et felt ikke begrænser.
Geokommunikation - visualisering af geografiske data.
10.mar. 15 Udvikling i løn, priser og konkurrenceevne Dansk Industri.
1 Fundamentale datastrukturer. 2 Definitioner: abstrakt datatype, datastruktur Elementære datastrukturer og abstrakte datatyper : arrays, stakke, køer,
Økonometri 1: Specifikation og dataproblemer1 Økonometri 1 Specifikation, og dataproblemer 9. november 2004.
Kjeld Tyllesen, PEØ, CBS1 Knap kapacitet, 2 varer Kjeld Tyllesen Erhvervsøkonomi / Managerial Economics Forudsætninger og Opgave.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Avlsmål i Norden Gert Pedersen Aamand Nordisk Avlsværdivurdering.
Økonometri 1: Specifikation og dataproblemer1 Økonometri 1 Specifikation og dataproblemer 2. november 2004.
Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen.
Økonometri 1: Dummy variable1 Økonometri 1 Dummy variable 24. marts 2003.
Kvantitative metoder 2: Den multiple regressionsmodel1 Kvantitative metoder 2 Den multiple regressionsmodel 26. februar 2007.
Grundlæggende teoretisk statistik
Globaliseringsredegørelse 21.mar. 11 Globaliseringsredegørelsen 2011 Grafer fra temakapitlet Eksporten som drivkraft for vækst og velstand.
VTU 2008 | Virksomhedstilfredshedsundersøgelse Aalborg Tekniske Skole Svarprocent: 27% (414 besvarelser ud af mulige)
Fra SNP til DGV Ulrik Sander Nielsen og Anders Fogh Informationsmøde 29. september 2011.
Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk prediktion Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik S. Nielsen Jørn Pedersen, Anders.
Informationsmøde 2014 NAV avlsværdital for ungdyroverlevelse
Præsentationens transcript:

Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Nordisk Avlsværdivurdering Dansk Kvæg ”Teknikken” i testdagsmodellen(1) Jørn Pedersen Dansk Kvæg, Afdeling for Specialviden

2 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Disposition Testdagsmodellen  Systematiske effekter  Tilfældige dyreffekter (avlsværdier) ”Teknikken” i testdagsmodellen(2) – Gert Pedersen Aamand  Effekt af Multi-trait model

3 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Systematiske effekter Den ”ikke-genetiske” del af TD-modellen  Kælvingsalder * tidsperiode  Drægtighedsdage  Goldperiode  Heterosis og genetiske grupper (phantom-parent)  Kontroldato * besætning  Laktationskurve * (måned * tidsperiode * klv.-alder)  Kurve * besætning * tidsperiode  Heterogen varians

4 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Kælvningsalder  Inddelt i måneder  For 1., 2. og 3. laktation  Øvre og nedre grænser  F.eks. SDM 1. laktation: under 18 – over 40  RDM: Vekselvirkning med raceandele (ABK, HOL)  Ved manglende fødselsdato udgår ALLE data !!  Fordi: Alderskorrektionen giver problemer

5 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

6 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Effekt af drægtighedsdage (DCC, days carried calf)  Erstatter: Samtidigt kælvingsinterval/tomdage  dage:Ikke drægtig eller under 120 dage  :0-dages klasser  240 og derover (de fleste køer er goldet)  og 3. laktation

7 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

8 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Effekt af golddage (foregående laktation)  Erstatter: Foregående kælvningsinterval  Registreret golddag eller  Beregnet ud fra sidste kontroldag med ydelse og næste kontrol/kælvning/afgang  7 dages intervaller 0-49 dage

9 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

10 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Heterosis og genetiske grupper  SDM: Uændret – effekterne mindre  DRH: Uændret – effekterne uændret  Jersey: Uændret – effekterne uændret  RDM: heterosis og rekombination  Generel krydsningseffekt (heterosis og rekombination)  RDMxABK, RDMxHOL, RDMxNordisk, ABKxHOL, ABKxNordisk: tilfældig (”regresset”)

11 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Kontroldag indgår i modellen Besætnings-kontroldato (HTD = Herd-Test-Dag) Erstatter besætningseffekterne (”managementgrupper”, HYS) Korrigere for:  Besætning, årstid(måned), år  Derudover: Påvirkning, der kun vedrører en enkelt kontroldag, f.eks. foderskift, personaleskift, vejrskift Hvilke effekter indgår:  1. laktationseffekter for sig  laktationseffekterne samlet

12 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Laktationskurven  En kurve pr. måned i 4 års-perioder (4 perioder)  1. laktation: 3 aldersgrupper:3 * 4 * 12=144 kurver  2. og 3. laktation hver især:4 * 12=48 kurver  I alt = 240 laktationskurver med forskellig form  Indenfor periode: Forskellig niveau fra år til år (960 kurver)  5 parameter kurver (a, b c, d, f) 3 i andengradsligning (parabel): a + b * dag + c * dag 2 Modellere det lange ”næste lige” stykke af kurven 2 eksponentielle led: + d * e k 1 * dag + f * e k 2 * dag Modellerer den første del af kurven

13 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

14 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Laktationskurve pr. besætning  Laktationskurverne bliver modificeret pr. besætning pr. 5-årsperiode  Lineær regression  Virkning: Kan gøre laktationskurverne mere eller mindre flade

15 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

16 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Heterogen varians Fremgangsmåde (iteration)  Beregning af avlsværdital  Korrektion for heterogen varians (pr. bes. x år)  Beregning af avlsværdital  Ny korrektion for heterogen varians  Osv. Heterogen varians pga. avlsværdier bliver ikke fjernet

17 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Heterogen varians  Ændret varians over tid – langt det vigtigste  Forskelle i varians mellem besætninger

18 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

19 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

20 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Avlsværdital Udvikler sig hen over laktationen ”Avlsværditalskurve” 4 parameter kurver (a, b c, d) Formel: a + b * dag + c * dag 2 + d * e k 1 * dag  3 første Led = andengradsligning (parabel):  Modellere det lange sidste stykke af kurven  4. eksponentielle led:  Modellere den første del af kurven  Ligner formel for fænotypisk laktationskurve  Det giver det bedste resultat  MEN det er IKKE en laktationskurve

21 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Beregningsteknik Lignede metode for permanent miljø pr. laktation  Der er mange  Det er teknisk vanskeligt – pga. høje korrelationer Kan reduceres uden nævneværdigt tab af information  6 avlsværdier for 1. laktation  8 avlsværdier for 2. og 3. laktation 4 avlsværdier pr. dyr, pr. egenskab(3), pr. laktation(3) – I alt 4*3*3 = 36 avlsværdier pr. dyr

22 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Trin i en avlsværdiberegning (1)  Dansk dataudtræk og editering  Data samles fra 3 lande – lidt kontrol  Opsætning af input-data til beregning incl. afstamning  Beregning af 14 avlsværdital pr. dyr Uden udenlandsk information – med HV-korrektion  Beregning af 14 avlsværdital pr. dyr Med udenlandsk information – data prækorrigeret for HV

23 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Trin i en avlsværdivurdering (2)  Konvertering fra 14 avlsværdital til 36 avlsværdital pr dyr  36 avlsværdital er ”regressionskoefficienter” Skal indsættes i formlen for ”avlsværditalskurve” Giver avlsværditallenes udvikling (positivt eller negativt) Ét avlsværdital pr. dag  Beregning af sum af ydelser i 305 dage  Standardisering – af gennemsnit og variation  Sammenvejning: Laktationer – egenskaber (Y-indeks)

24 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

25 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

26 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

27 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg

28 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Hvad er anderledes i en testdagsmodel? Systematiske effekter  Kælvingsalder * tidsperiode  Drægtighedsdage  Goldperiode  Heterosis og genetiske grupper (phantom-parent)  Kontroldato * besætning  Laktationskurve * (måned * tidsperiode * klv.-alder)  Kurve * besætning * tidsperiode  Heterogen varians

29 Dansk Landbrugsrådgivning Landscentret | Dansk Kvæg Hvad er anderledes i en testdagsmodel?  ” Avlsværditalskurve”  Avlsværdital for 1., 2. og 3. laktation separat Incl. afstamning/forventning Nye muligheder  Avlsværdital for persistens  Avlsværdital for ”maturity” – forhold mellem avlsværdi fra forskellige laktationer  Andre muligheder !!