Opbygning af en reference- population for nye (og gamle) egenskaber L.H. Buch, M.K. Sørensen og A.C. Sørensen

Sikkerheden på DGV’erne afhænger af: Egenskabens arvbarhed eller sikkerheden på tyrenes avlsværdital Antal genotypede dyr med fænotypiske registreringer Antal markører (3K, 50K, HD) Koblingsuligevægt (LD) Sikkerheden på DGV’erne DGV = Direkte genomiske avlsværdital

Koblingsuligevægt Allel Q er favorabel m q m mq m m m m q q Q q q q m M Q M MQ M M M M Q Q Q Q Q q M

Sikkerheden på indekset Sikkerheden på indekset = + Slægtskab Koblings- uligevægt I denne undersøgelse Sikkerheden på DGV’en DGV = Direkte genomiske avlsværdital

Sikkerheden på indekset Sikkerheden på indekset = + Slægtskab Koblings- uligevægt I virkeligheden Sikkerheden på DGV’en Slægtskab * × DGV = Direkte genomiske avlsværdital * Som kan forklares med markører Slægtskab

Registrering af nye egenskaber Nye (ofte funktionelle) egenskaber Nye egenskaber registreres muligvis kun på en mindre del af populationen Færre tyre får døtre med fænotypiske registreringer

Antal genotypninger er begrænsende Referencepopulationen tilføres hvert år: T30: 30 tyre med 500 døtre T30_K2000: 30 tyre med 500 døtre og 2000 køer med fænotypiske registreringer T30_TT170: 30 tyre med 500 døtre og 170 testtyre med 100 døtre

Generelle forudsætninger Arvbarhed på 0, informative markører (50K) Turboplan – tyrene anvendes i avlen så snart de er kønsmodne

Sikkerheden på DGV’erne hvis antal genotypninger er begrænsende

Køer versus (test)tyre når h 2 = 0,05 Sikkerhed0,150,200,25 Tyre med 500 døtre Testtyre med 100 døtre Køer × 43

Køer versus (test)tyre når h 2 = 0,30 Sikkerhed0,150,200,25 Tyre med 500 døtre Testtyre med 100 døtre Køer × 21

Antal fænotypiske registreringer er begrænsende Referencepopulationen tilføres hvert år: K4000: 4000 køer med fænotypiske registreringer T30_D133: 30 tyre med 133 døtre h 2 = 0, informative markører Turboplan

Sikkerheden på DGV’erne hvis antal fænotypiske registreringer er begrænsende

Anbefaling for nye egenskaber Lavere sikkerheder på DGV’erne for nye funktionelle egenskaber Stor værdi af at inddrage flere dyr i referencepopulationen end brugstyrene

Forudsætning  Den eksisterende referencepopulation giver en DGV sikkerhed på 60%  Der opsamles ikke flere fænotyper, hverken på køer eller tyre. Men hvad sker der med ”gamle” egenskaber?

Men hvad sker der med ”gamle” egenskaber, hvis sikkerheden alene afhænger af koblingsuligevægt? Sikkerhed Antal generationer En illustration

Men hvad sker der med ”gamle” egenskaber hvis sikkerheden afhænger af både koblingsuligevægt og slægtskab? Sikkerhed Antal generationer En illustration Både slægtskab og koblingsuligevægt

Sikkerheden falder, hvis vi mangler fænotyper Calus et al., 2010

Årsag til faldet Fra 2 til 3: Dyrene er ikke med i referencepopulationen Fra 3 til 4: Dyrene er mindre beslægtede med referencepopulationen

Sikkerheden falder, hvis vi mangler fænotyper (Nordiske resultater) R 2 DGV,EBV Far i referencepop. Far ikke i referencepop. Frugtbarhed0,410,33 Protein0,410,36 Yversundhed0,440,34 Mogens Sandø Lund et al., 2009

Konklusion Registrering fortsat nødvendig  For at opnå høj DGV sikkerhed på ”nye” egenskaber  For at opretholde/forøge DGV sikkerheden på ”gamle” eg. Stadig anbefalelsesværdigt at teste tyre for at styrke referencepopulationen  Af hensyn til både ”nye” og ”gamle” egenskaber Acceptabel sikkerhed på DGV-er for ”nye” egenskaber fås hurtigst med køer i referencepopulationen Genomisk teststrategi meget afhængig af testpris (tyre vs. køer)