• Alternativ splejsning •

Præsentationer af emnet: "• Alternativ splejsning •"— Præsentationens transcript:

1 • Alternativ splejsning •
Molekylærdiversitet • Alternativ splejsning •

2 Et gen → flere polypeptider?
DNA Pre-mRNA mRNA polypeptid

3 Et gen → flere polypeptider?
DNA Pre-mRNA mRNA polypeptid Multiple startsites for transkriptionen

4 Et gen → flere polypeptider?
DNA Pre-mRNA mRNA polypeptid Multiple startsites for transkriptionen Post-translationelle modifikationer

5 Et gen → flere polypeptider?
DNA Pre-mRNA mRNA polypeptid Multiple startsites for transkriptionen • Alt. polyadenylation • Editering • Alt. splejsning Post-translationelle modifikationer

6 Definition Splejsning ~ den proces, hvorved introns fjernes fra pre-mRNA og exons samles til et mRNA Alternativ splejsning ~ den proces, hvorved multiple mRNA kan dannes ud fra det samme pre-mRNA v. differentiel samling af 5’ og 3’ splicesites. Dvs. exons kan • forlænges/forkortes • skippes/inkluderes endvidere kan introns inkluderes

7 Splejsningsprocessen (den korte version)
Spliceosom ~ det makromolekylære kompleks, hvis bestanddele dynamisk forenes/samles på pre-mRNA´et for at katalysere splejsningen • 5 snRNA (small nuclar RNA) proteiner

8 Splejsningsprocessen (den korte version)
1. Spliceosomal genkendelse 5’ og 3’ splice site

9 intron exon exon

10 Splejsningsprocessen (den korte version)
Spliceosomal genkendelse 5’ og 3’ splice site 5’ klippes og kobles sammen m. adenin i barnchpoint

11 Lasso-formationen

12 Splejsningsprocessen (den korte version)
Spliceosomal genkendelse 5’ og 3’ splice site 5’ klippes og kobles sammen m. adenin i barnchpoint Der klippes v. 3’ splice site og exons splejses sammen

13

14 Mekansimen bag alternativ splejsning (den korte version)
Regulatoriske proteiner vekslevirker med specifikke pre-mRNA sek- venser og stimulerer el. undertrykker exon genkendelse

15 Grafisk fremstilling af konstitutive og alternative splejset exons i et pre-mRNA
Alt. Splejset exon Konstitutivt splejset exon

16 Dscam - et eksempel på et alternativt splejset gen
Dscam er et gen fra D.melanogaster • koder for en axon guidance receptor • pre-mRNA kan alt. splejses til forsk. isoformer

17 Dscam -et eksempel på et alternativt splejset gen

18 Alternativ splejsning - mekanismen bag højere ordens kompleksitet?

19 Hvilke træk karakteriserer en kompleks organisme?

20 Hvilke træk karakteriserer en kompleks organisme?
• proteomets størrelse (antallet af forsk. byggesten)

21 Hvilke træk karakteriserer en kompleks organisme?
• proteomets størrelse (antallet af forsk. byggesten) • komplekst regulatorisk netværk (vekselvirkningen ml. de forsk. byggesten)

22 Hvordan kan proteomet blive større?
ved at øge antallet af gener udv. af et system, som udvider genomets kodende kapacitet

23 Hvordan kan proteomet blive større? ved at øge antallet af gener?
udv. af et system, som udvider genomets kodende kapacitet

24 antal gener: ~ ~ ~

25 Hvordan kan proteomet blive større?
ved at øge antallet af gener udv. af et system, som udvider genomets kodende kapacitet?

26 Alternativ splejsning øger et gens kodende kapacitet, men er der ml
Alternativ splejsning øger et gens kodende kapacitet, men er der ml. de tre organismer forskel på • andelen af gener som alt. splejses?

27 Alternativ splejsning øger et gens kodende kapacitet, men er der ml
Alternativ splejsning øger et gens kodende kapacitet, men er der ml. de tre organismer forskel på • andelen af gener som alt. splejses? • antallet af alt. splejsninger pr. gen?

28 Brett, D. et. al. Nature genetics 30, 29-30 (2002)
konkluderer: • omtrent lige stor del af gener alt. splejses

29 Brett, D. et. al. Nature genetics 30, 29-30 (2002)
konkluderer: • omtrent lige stor del af gener alt. splejses • omtrent samme antal alternative splejseformer pr. gen

30 Brett, D. et. al. Nature genetics 30, 29-30 (2002)
konkluderer: • omtrent lige stor del af gener alt. splejses • omtrent samme antal alternative splejseformer pr. gen Der splejses forholdsvis lige meget! • øvre grænse?

31 Hvordan forklares kompleksitets forskellen så?
Er der forskel på proteom størrelsen ml. de tre org.? • hvis ja, hvilke(n) mekanisme ligger bag? (måske ikke AS) • hvis nej, skyldes forskellen så forskellighed i de regulatoriske systemer?