Strukturen af transkriptionsaktivatorer

Præsentationer af emnet: "Strukturen af transkriptionsaktivatorer"— Præsentationens transcript:

1 Strukturen af transkriptionsaktivatorer
DNA bindende domæne Transkriptionsaktiverende domæne Eventuelt et dimeriseringsdomæne

2 Transkriptionsaktiverende domæne
DNA bindende domæner Zink indeholdende faktorer Homeodomæner basiske leucin zippers basiske helix-loop-helix Transkriptionsaktiverende domæne Sure aminosyrer Glutamin rigt domæne Prolin rigt domæne

3 Zink finger struktur a-helix-loop-b-strand to histidiner i a-helix to cysteiner i b-sheet

4 aminosyrer i a-helix kontakter DNA i major groove

5 Gal4p eksempel på en zink holdig transkriptionsfaktor uden fingerstruktur
zink koordineres af 6 cysteiner kort helix genkender DNA target binder i major groove

6

7 Kernereceptorer har zinkioner, der er koordineret af fire cysteiner

8

9 Homeodomæner indeholder helix-turn-helix strukturer

10 Homeobox domæner helix turn helix Den ene helix genkender major groove i DNAet

11 bZIP, basisk leucin zipper
dimeriserer via leucin resterne og binde DNA i major groove via basiske aminosyrer

12 Basisk helix-loop-helix protein

13 Rekrutering af RNA polymerase holoenzymet til promotoren

14 Eukaryote transkriptionsfaktorer stimulerer binding af generelle transkriptionsfaktorer og RNA polymerasen til promotorer. Hvordan ?

15 Hvilke dele af det generelle transkriptionsapparat der interagerer med en transkriptionsaktivator kan bestemmes ved et pull-down eksperiment eller 2-hybrid analyse

16 Assay til bestemmelse af generelle transkriptionsfaktorer, der interagerer med det sure transkriptionsaktiverende domæne af GAL4

17

18

19

20

21

22