Proteiner - Opbygning og Funktion

Præsentationer af emnet: "Proteiner - Opbygning og Funktion"— Præsentationens transcript:

1 Proteiner - Opbygning og Funktion
Af Christian Bukh

2 Det Centrale Dogme - Fra gen til protein
Chr Bukh KU-LIFE Slide 2 Det Centrale Dogme - Fra gen til protein Raven & Johnson - Fig 15.5 Raven & Johnson

3 Strukturelementer - Byggeklodser
Chr Bukh KU-LIFE Slide 3 Primær - sekvensen NH3+ COO- R Aminosyre Sekundær Raven & Johnson – fig 3.7 Tertiær Kvartenær Raven & Johnson

4 Primær struktur – Dannelse af Peptidbindingen
Chr Bukh KU-LIFE Slide 4 Primær struktur – Dannelse af Peptidbindingen Aminosyre Peptidbinding Garrett and Grisham – Fig 4.15 Garrett & Grisham

5 Chr Bukh KU-LIFE Slide 5 Sidekæderne - R Lehninger Voet & Voet

6 Aminosyrerne - Oversigt
Chr Bukh KU-LIFE Slide 6 Lehninger

7 Stabilitet af den tertiære struktur
Chr Bukh KU-LIFE Slide 7 Stabilitet af den tertiære struktur

8 Sekundær struktur - α-helix
Chr Bukh KU-LIFE Slide 8 Sekundær struktur - α-helix 3.6 aminosyre per turn med en afstand på 5.4 Å O(i) til N(i+4): hydrogen binding Voet & Voet Lehninger

9 Sekundær struktur – α-helix
Chr Bukh KU-LIFE Slide 9 Sekundær struktur – α-helix Myoglobin – α-Helix-holdigt protein 1mbo.pdb

10 Sekundær struktur - β-sheet
Chr Bukh KU-LIFE Slide 10 Sekundær struktur - β-sheet Anti-parallel Parallel Stryer Stryer

11 Sekundær struktur - β-sheet
Chr Bukh KU-LIFE Slide 11 Sekundær struktur - β-sheet β-Sheet – immunoglobolin 8fab.pdb

12 Tertiær struktur Den overordnede 3-dimentionelle struktur
Chr Bukh KU-LIFE Slide 12 Tertiær struktur Den overordnede 3-dimentionelle struktur Rummelig opbygning Nærmeste rummelige nabo kan have primær adresse langt væk !? Myoglobin 1mbo.pdb

13 Hæmoglobin - Kompleks med 4 subunits
Chr Bukh KU-LIFE Slide 13 Kvartenær struktur Hæmoglobin - Kompleks med 4 subunits 1bab.pdb

14 Denaturering Stabilitet af proteinstrukturen ødelægges
Chr Bukh KU-LIFE Slide 14 Denaturering Stabilitet af proteinstrukturen ødelægges Faktorer i spille: pH – påvirker hydrogenbindinger og ladninger af sidekæder (Destabiliserende) Detergenter (sæbe og alkoholder) – hydrofobe regioner påvirkes (Destabiliserende) Salte – Kan have positiv (stabiliserende) eller negativ (destabiliserende) effekten

15 Insulin Peptid-hormon Regulering af glucose-niveau i blodet
Chr Bukh KU-LIFE Slide 15 Insulin Peptid-hormon Regulering af glucose-niveau i blodet Udtrykkes ikke ved Type 1 diabetes (almindelig sukkersyge) Udtrykkes i bugspytkirtlen som proinsulin - peptidstreng på 84 aminosyrer

16 Chr Bukh KU-LIFE Slide 16 Proinsulin  Insulin   Enzym  Enzym

17 Ekspression af insulin
Chr Bukh KU-LIFE Slide 17 Ekspression af insulin Gen fra menneske klones

18 Enzym - funktion Ikke katalyseret Katalyseret Pr. sec
Chr Bukh KU-LIFE Slide 18 Enzym - funktion Ikke katalyseret Katalyseret Raven & Johnson – fig 8.7 Pr. sec Raven & Johnson

19 Enzym - katalyse Raven & Johnson – fig 8.9 Raven & Johnson
Chr Bukh KU-LIFE Slide 19 Enzym - katalyse Raven & Johnson – fig 8.9 Raven & Johnson

20 Chr Bukh KU-LIFE Slide 20 Enzymer og pH Giver normalt information om sidekæderne, der indgår i reaktionen Raven & Johnson

21 Chr Bukh KU-LIFE Slide 21 Enzymer og Temperatur Stabilitet af termostabile enzymer. Ofte grundet øget antal hydrogenbindinger. Raven & Johnson

22 Alkohol dehydrogenase
Chr Bukh KU-LIFE Slide 22 Alkohol dehydrogenase Substratbinding og adgang for substrat 1adb.pdb