Forskningsprojekter i Molekylærpatologi Siegfried Loeschke, sp. ansv. Overlæge, Patologisk Institut, Sønderborg Sygehus.

Præsentationer af emnet: "Forskningsprojekter i Molekylærpatologi Siegfried Loeschke, sp. ansv. Overlæge, Patologisk Institut, Sønderborg Sygehus."— Præsentationens transcript:

1 Forskningsprojekter i Molekylærpatologi Siegfried Loeschke, sp. ansv. Overlæge, Patologisk Institut, Sønderborg Sygehus

2 Molekylærpatologi Molekylærpatologi beskæftiger sig med de molekylære (genetiske og epigenetiske) årsager og forandringer af (kræft-) sygedommer. Til den behøv bruger man molekylærbiologiske metoder.

3 Molekylærpatologi i Sønderborg Sygehus Sønderjylland har investeret og opbygget et moderne molekylærpatologisk laboratorium som kan gennemføre næsten alle analyser i området. Blandt andet står til rådighed: Laser-Microdissection (LMD) PCR, RT-PCR, qRT-PCR, FISH Fragmentlængdeanalyse Sekvensering, Cellekultur

4 Projekter Molekylærpatologi Projekter er i forskellige stadier: Afsluttet Delvis afsluttet Løbende Planlægningsfase ideer

5 Afsluttet projekter Prognostik Markers in Cancers of the Oral Cavity Retrospektiv Deasease free survival/Over all survival Klinisk data TNM data p16 HPV HMGA2

6 Prognostic Markers Oral Cancer III

7 Prognostic Markers Oral Cancer IV

8 Delvis afsluttet Høj kvalitet RNA ud af formalin fikseret væv Optimere fikseringsprocessen og vævs preparering Bachelorprojekt

9 Høj kvalitet RNA af formalin fikseret væv

10 Høj kvalitet RNA af formalin fikseret væv II PathosVIPKold PathosKold VIPHopeFrys 35067 I5,266,28,32,87,7 35067 IIN/A6,5N/A3,13,8N/A 36036 I66,65,85,32,94,1 36036 II3,93,57,173,94 35956 I2,4 13,12,52,7 35956 II2,23,12,42,82,31,2 36530 I2,42,72,82,62,24,4 36530 II2,43 3,2N/A3,8 36529 I32,82,472,65,8 36529 II2,52,6N/A2,82,65,2 36531 I2,3N/A 5,92,9N/A 36531 II2,6N/A2,9 4,24,9 37001 I3,1N/A3,172,96,7 37001II2,75,72,87,745,6 37639 I2,52,8 3,32,74,7 37639 II3,34,43,97,52,54,6 37640 I2,564,83,72,66 37640 II3,84,33,27,73,8N/A 38698 I3,35,42,96,32,65,5 38698 II3,82,54,46,22,56,3

11 Høj kvalitet RNA af form. fikseret væv III Erfaringen viser at kvalitet aftager hurtigt ved opbevaring på stuetemperatur. Næste skridt: Nyt bachelorprojekt for finde bedst muligt opbevaring (er på vej)

12 Plannet /lige begyndt Prognostic markers for the Identification of high- risk patients for recurrent disease of early stage Non-Small-Cell-Lung-Cancer Kooperation med lungekirurgisk afdeling T og patologi OUH PhD projekt Ansøgt Regionens Forskningsfonden Ansøger lige på PhD skolen

13 Progn. markers for high-risk patients for recurrence of early stage Lung-Cancer Målet: At finde markører på DNA, mRNA og miRNA niveau for tumorer med høj risiko for recidiv Som metoder kommer FISH, LMD, ARMS-PCR, qRT-PCR og RT-PCR for miRNA til anvændelse. Start: Sommer/efterår i år

14 Stamceller i Lungevævet Langvarig kooperationsprojekt med lungekirurgi og patologi i Flensborg Spørgsmåler: Hvor sidder stamceller i lungevævet hinde? Kan lunge stamceller i de identificeret regioner visualiseres? Findes der ”bystander cells” lige som i knoglemarven? Kan man via ”bystander cells” regulere aktiviteten af stamceller? Findes de celler også i lungecancer?

15 Stamceller i Lungevævet Metoder: LMD Histokemie Immunhistokemi Sekvensering Vævskultur Fluorescensmikroskopi Mm. Status: Aftaler, forarbejder

16 Stamceller i Lungevævet Kandidatregioner Kotton et al, Lung stem cells. Cell Tissue Res. 2007

17 Stamceller i Lungevævet Histokemi for identifikation af monoklonale områder

18 Metastaser af ukendt primærtumor Sommetider findes tumorer som er sandsynligvis metastaser, men der findes ingen primærtumor Optimal behandlingen er tit afhængig af udgangsorgan Med konventionelle teknikker kan kun identificeres udgangsorgan i en fåtal Prøve at finde miRNA fingerprint i kombination med morfologi, immunhistokemi og LMD

19 Metastaser af ukendt primærtumor II Sammearbejdsprojekt med klinkische und experimentelle Pathologie, Forschungszentrum Borstel Konceptionsfase Ansøges til Direktionensforskningspulje

20 Dit Projekt Vi tilbyder: Næsten alle Molekylærpatologiske undersøgelser: Histologi/cytologi Immunhistologi LMD FISH PCR, RT-PCR qRT-PCR miRNA RT-PCR ARMS-PCR Rådgivning til forskningsprojekter med molekylær patologi

21 Tak for opmærksomheden