Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.

Præsentationer af emnet: "Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”."— Præsentationens transcript:

1 Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Two-dimensional hetero correlation experiments HSQC, HMQC, HMBC, H2BC NTDR, 2012 Nils Nyberg NPR, Department of Drug Design and Pharmacology

2 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Outline Two dimensional correlation experiments Short review of experiments Example of HSQC, HMBC and H2BC Second dimension and how to optimize the results Choosing delays in HMQC/HSQC and HMBC H2BC NTDR, 2012

3 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Two-dimensional correlation experiments Experiment review and type of information COSYH-H couplings NOESYThrough space HMQC,HSQCOne bond HMBCMultiple bonds H2BC (COSY+HSQC) Two bonds NTDR, 2012

4 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Two-dimensional correlation experiments Mark expected correlations (but not all HMBC-correlations) COSY, 3 J H,H NOESYHSQC, 1 J H,C HMBC, 2 J H,C HMBC, 3 J H,C H2BC, 2-bond H-C correlations NTDR, 2012

5 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Two-dimensional correlation experiments Mark expected correlations COSY, 3 J H,H NOESYHSQC, 1 J H,C HMBC, 2 J H,C HMBC, 3 J H,C H2BC, 2-bond H-C correlations NTDR, 2012

6 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod HSQC NTDR, 2012

7 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod HSQC + H2BC NTDR, 2012

8 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod HSQC + H2BC + HMBC NTDR, 2012

9 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod HSQC + H2BC + HMBC NTDR, 2012

10 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod The second dimension in homonuclear experiments Prepare – evolution – mix – detect t1t1 t2t2 f1f1 f2f2 Fourier transform NTDR, 2012

11 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod The second dimension in heteronuclear experiments Prepare – evolution – mix – detect t1t1 t2t2 C f 1 H f 2 Fourier transform NTDR, 2012

12 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Design of experiments Double resonance experiment (with two different nuclei) Several channels on the spectrometer (at least two) 1 H and 13 C 1 H and 15 N 1 H and 31 P Probe with coils for all nuclei frequencies Single coil, doubly tuned Dual probes dedicated to e.g., 1 H + 13 C Broadband probes, 1 H + ( 109 Ag – 31 P) Inverse configuration (inner coil 1 H) Normal configuration (inner coil X-nuclei) http://chemnmr.colorado.edu/moreinfo/instruments/probe_whatis.html NTDR, 2012

13 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Design of experiments The most sensitive experiments start with 1 H and detects the 1 H-signal. ”Inverse experiments” 1 H – 13 C: 32 times more sensitive 1 H – 15 N: 300 times more sensitive NTDR, 2012

14 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Resolution and time of 1 H-detected experiments Direct dimension, 1 H (= High resolution) Double number of scans => Double time Indirect dimension, 13 C (= Low resolution) Number of increments in second dimension Double resolution => Double time 13 C f 1 1 H f 2 512 rows 240 ppm (36 kHz @ 150 MHz) 70 Hz/row High dispersion, singlets, minimal overlap 1024 points (4 scans) 8 ppm (4.8 kHz @ 600 MHz) ~5 Hz/point NTDR, 2012

15 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Optimal use of experiment time Sample preparation High concentration (but not too high...) Particle free, easy to shim Optimize spectrometer Tune/match/pulse calibration Shimming Minimize spectral width in indirect dimension Favor high S/N instead of high resolution Post processing Window function (QSINE, ssb 2) Linear prediction (better version of zero filling) NTDR, 2012

16 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Post processing of HMBC QSINE ssb 2 in both directions Linear prediction (128 -> 1024) XFB (pk in f1) + XF2m NTDR, 2012

17 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Post processing of HMBC QSINE ssb 2 in both directions No linear prediction (zero filling, 128 -> 1024) XFB (pk in f1) + XF2m NTDR, 2012

18 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Post processing of HMBC QSINE ssb 1 in both directions Zero-filling, No linear prediction XFB (mc in f1) NTDR, 2012

19 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod HMQC and HSQC Correlates 1 H to 13 C (or 31 P, 15 N,...) Identifies diasterotopic pairs Dispersion of signals in crowded regions in a second dimension HMQC Few pulses, robust, broadening in f1 due to passive couplings (H-H couplings) HSQC Less robust, need carfuly calibrated pulses, narrow peaks NTDR, 2012

20 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod HMQC and HSQC Optimal delay, Δ = (2 x 145) -1 ~3.3 ms Decoupling during acquistion HSQC HMQC NTDR, 2012

21 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Removal of 1 H signals connected to 12 C A major obstacle of 1 H detected heteronuclear experiments is to ”filter” all signals from 1 H bound to 13 C (1%) from 1 H bound to 12 C (99%) Phase cycling Pulsed field gradients (PFG) Coherence selection 13 C-satelites Inverted by phase cycling Difference NTDR, 2012

22 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Choosing delays in HMBC HMBC is similar to HMQC, but with a longer delay in the preparation part to be more sensitive to long-range H-C couplings. Tune delay to expected coupling size [1/(2 x n J C,H )]. But too long delay => less signal due to relaxation... 65 ms ~7-8 Hz HMQC HMBC NTDR, 2012

23 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Choosing delays in HMBC Green: 200 ms [2.5 Hz] Red: 65 ms [7.7 Hz] NTDR, 2012

24 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod H2BC – two bond correlation HMBC = Heteronuclear Multiple Bond Correlation H2BC = Heteronuclear Two Bond Correlation Constant time experiment H,H coupling during T (COSY), H-C transfer during Tau (HMQC) NTDR, 2012

25 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod H2BC example Edited version – different signals for CH 2 and CH/CH 3 Prednisolon NTDR, 2012