Præsentation er lastning. Vent venligst

Præsentation er lastning. Vent venligst

Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk prediktion Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik S. Nielsen Jørn Pedersen, Anders.

Lignende præsentationer


Præsentationer af emnet: "Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk prediktion Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik S. Nielsen Jørn Pedersen, Anders."— Præsentationens transcript:

1 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk prediktion Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik S. Nielsen Jørn Pedersen, Anders Fogh

2 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Nuværende 2-step metode 19. april 2015 2... | SNP og deregressed proof (DRP) Direct genomic values (DGV) Genomic enhanced breeding values (GEBV)

3 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Grunddata: Deregressed proof 19. april 2015 3... | Feltdata (kg protein, behandling af yverbetændelse) Systematisk påvirkning (kælvningsalder, kælvningsmåned osv.) Avlsværdital Deregressed proof (DRP) Afhængig af sikkerhed Justeret fænotype

4 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Grunddata: Deregressed proof 19. april 2015 4... | Afstamning DRP Avlsværdital Egen ydelse + afstamning Afvigelse fra afstamning ud fra egen ydelse

5 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Deregressed proof (DRP) - genotypede dyr Hundyr: Egen fænotypisk afvigelse fra forældrene - hvis dyret skal have det opnåede avlsværdital Tyre: Døtrenes fænotypiske afvigelse opfattes som fænotype på tyren. Afvigelse af denne fra tyrens forældre - hvis tyren skal have det opnåede avlsværdital 5... | Fænotype tælles kun med én gang!

6 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Hundyr i referencegruppen - information fra 10 døtre efter tyr med 1. laktationsydelser 6... | Justeret fænotype Testede køer Ikke testede køer Justeret fænotype

7 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation DRP - anvendt slægtskab for testede dyr Tidligere rutine: Sire, MGS Ny: Sire, Dam (Animal model) Fordel: DRP er tættere på dyrets reelle ydelsesafvigelse 7... |

8 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation DRP - anvendt slægtskab for testede dyr 8... | Kendt afstamning: 0,5 + 0,25 + 0,125 + 0,0625 = 0,9375 + fantom Kendt afstamning: 0,5 + 0,25 = 0,75 + fantom Nu Tidligere

9 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Avlsværdiberegning - Testede køer og afprøvede tyre med DRP DRP = μ + Av. dyr + e Ved benyttelse af: Genomisk slægtskab giver DGV Traditionel slægtskab giver EBV 9... |

10 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Slægtsskab ud fra SNP 19. april 2015 10...| !Tyr !Helbror Genomisk slægtsskab: 0 - 1 Traditionel slægtsskab: 0,5

11 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Avlsværdiberegning - Testede kvier og unge tyre uden DRP DRP = μ + Av. dyr + e Ved benyttelse af: Genomisk slægtskab giver DGV for kandidater Traditionel slægtskab giver afstamningsindeks 11...|

12 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Blending DGV: Afstamning (genomisk), afprøvning (DRP) EBV: Afstamning (traditionel), afprøvning (DRP) Kombineres – MEN meget stor overlap af information Ny metode undgår bedre ”double counting”, hvilket gør det lettere at inkludere hundyr i referencegruppen 12...|

13 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Reference population August 2014 Reference population TyreKøer Holstein25700 a) - RDC7800 b) 10000 Jersey2400 c) 6800 13 a) Inkluderer afprøvede tyre fra NLD, FRA, DEU, ESP b) Inkluderer afprøvede tyre fra NOR c) Inkluderer afprøvede tyre fra USA

14 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk information øger sikkerheden væsentligt for kandidater! Sikkerhed på seneste 4 årgange afprøvede tyre sammenlignet med sikkerhed på afstamnings- information Eks: Sikkerhed på DGV45% Sikkerhed på afstamning20% Ekstra sikkerhed25% 14

15 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Ekstra sikkerhed – ud over afstamning for RDC Reference population TyreTyre og køer Mælk0,170,23 Fedt0,160,23 Protein0,120,18 Ydelse0,130,18 Frugtbarhed0,14 Fødsel0,18 Kælvning0,02 Yversundhed0,170,23 Øvrige sygdomme0,14 Kropskapacitet0,240,29 Lemmer0,240,33 Yver0,230,30 Malketid0,170,22 Temperament0,180,21 Holdbarhed0,07 15

16 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Ekstra sikkerhed – ud over afstamning for HOL Reference population TyreTyre og køer Mælk0,47 Fedt0,410,42 Protein0,360,37 Ydelse0,320,34 Frugtbarhed0,31 Fødsel0,30 Kælvning0,23 Yversundhed0,35 Øvrige sygdomme0,07 Kropskapacitet-- Lemmer0,23!! Yver0,490,51 Malketid0,480.48 Temperament0,110.12 Holdbarhed0,120.12 16

17 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Ekstra sikkerhed – ud over afstamning for JER Reference population TyreTyre og køer Mælk0,230,37 Fedt0,130,21 Protein0,180,32 Ydelse0,160,22 Frugtbarhed0,17 Fødsel0,00 Kælvning-0,02 Yversundhed0,090,16 Øvrige sygdomme-0,11 Kropskapacitet0,190,30 Lemmer0,050,13 Yver0,260,29 Malketid0,150,34 Temperament0,00 Holdbarhed0,11 17

18 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Stadig forskel i sikkerhed mellem racer Sikkerheder for RDC og Jersey er stadig 12- 15% point lavere end HOL – men højere end før! Forventer yderligere stigning i sikkerhed når flere genotypede RDC and Jersey køer indgår i referencepopulationen. 18

19 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Underestimering er væk! For RDC og Jersey er indekser steget for unge tyre og kvier RDC: 4 indeksenheder for ydelse og NTM 0-2 indeksenheder andre egenskaber, hvor køer indgår i referencepopulationen 19

20 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Underestimering er væk! For RDC og Jersey er indekser steget for unge tyre og kvier Jersey: 2 indeksenheder for ydelse og NTM 0-1 indeksenheder andre egenskaber, hvor køer indgår i referencepopulationen 20

21 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Sammenhænge - Tidligere vs. nu RDCJersey Egenskaber Genotypede Unge tyre/ kvierKøerUnge tyre/ kvierKøer Uden køer i ref. 0,97-0,99 0,94-0,96 Med køer i ref. 0,88-0,930,89-0,920,77-0,850,87-0,90 21

22 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation 22 Blå = Ny, Rød = tidligere rutine

23 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation 23

24 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation 24

25 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation 25

26 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Konklusion – Hvad er forbedret? RDC/JERTidligere rutineNy Afstamning Sire-Maternal grandsire Animal Model Betydning for kandidater, samt køer for egenskaber med stærk trend Reference population TyreTyre og køer 6.800 Jersey og 10.000 RDC Blending metodeUdviklet af MTT i 2010 Opdateret af MTT i 2013/14 Tager bedre hånd om “Double counting” 26

27 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Konklusion Ny model implementeret 2. juli for RDC/JER Positivt modtaget – flere forbedringer på vej Ny model for ydelse hos HOL er sendt til Interbull test Implementering snarest hos HOL 27

28 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation 28

29 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Testede hundyr per land og fødselsår ÅrHolsteinRDCJersey DNKFINSWEDNKFINSWEDNKFINSWE 200735035543279257401 20086415875641663311800 20098671381359029210614915 20101090346144502183212482175142 20111545931350804326617663921487 201221471181540101328281885406015110 20133157172410321182195915632011874 201410804201263423406247510 Total114614863255640661083367351307830331 Holstein total : 18880RDC total : 21634Jersey total : 13439

30 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation LD-projekt Antal hundyr med og uden egen ydelse Oktober 2014 AntalDNKFINSWETotal RDC Med ydelse952381624597227 Uden ydelse98718009063693 JER Med ydelse3529363565 Uden ydelse21892282219

31 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Niveau af genomisk testede Holstein Oktober 2014 Tyre med STBTyre uden STBHundyr FødtAntalNTMAntalNTMAntalNTM 20083056,05270,17744,5 20093029,18192,411405,2 201025014,68886,015808,6 201120018,915059,9282610,3 201222424,4192814,1386912,8 201316929,7217919,1591717,7 2014833,4181223,3162720,6

32 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Niveau af genomisk testede RDC Oktober 2014 Tyre med STBTyre uden STBHundyr FødtAntalNTMAntalNTMAntalNTM 20082583,0603,42636,8 20092475,93433,04886,1 201025611,37366,435824,8 201129315,0151710,758367,2 201226719,9207013,130619,8 201322623,4212016,1469814,3 20142125,2125920,174418,1

33 Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Niveau af genomisk testede JER Oktober 2014 Tyre med STBTyre uden STBHundyr FødtAntalNTMAntalNTMAntalNTM 2008473,133-1,22046,2 2009588,41243,72376,2 2010729,71793,825674,1 20117311,43256,041404,9 20125814,13708,841856,4 20136416,638811,220929,5 2014--30013,747611,6


Download ppt "Nordisk Avlsværdi Vurdering Nordic Cattle Genetic Evaluation Genomisk prediktion Informationsmøde 8. oktober 2014 Ulrik S. Nielsen Jørn Pedersen, Anders."

Lignende præsentationer


Annoncer fra Google