Egenskaber ved sorter af vårbyg til økologisk dyrkning – BAR-OF Molekylære markører Sortsforsøg Sortsblandinger Næringsstofoptagelse Sygdomskomplekser.

Præsentationer af emnet: "Egenskaber ved sorter af vårbyg til økologisk dyrkning – BAR-OF Molekylære markører Sortsforsøg Sortsblandinger Næringsstofoptagelse Sygdomskomplekser."— Præsentationens transcript:

1 Egenskaber ved sorter af vårbyg til økologisk dyrkning – BAR-OF Molekylære markører Sortsforsøg Sortsblandinger Næringsstofoptagelse Sygdomskomplekser Ukrudt Matematik og statistik

2 Egenskaber ved sorter af vårbyg til økologisk dyrkning – BAR-OF Molekylære markører Sortsforsøg Sortsblandinger Næringsstofoptagelse Sygdomskomplekser Ukrudt Matematik og statistik

3 Hvorfor DNA markører i BAR-OF? Til at beskrive genetisk diversitet mellem linierne/sorterne Til at sammenligne molekylære markører og morfologiske egenskaber til sortsbestemmelse Til at beskrive forandringer i sammensætning af sortsblandinger gennem forsøgstidsrummet Til at lokalisere gener for egenskaber med betydning i økologisk landbrug på kromosomfragmenter

4 Hvilke DNA markører bliver brugt? Mikrosatelliter = SSR (Simple Sequence Repeats) TGTGGGGCCACAAAACGTATAGATCAAAGTAATAATAATATTGATTAAATG ATATATATATATATATATATATATATATATATATAT CTAGAAGTTGTAGAAGACTAGCTAGAACGTACG Eksempel:

5 Detektering af polymorfier AC n

6 Fordeling af markørgrupper 96 linier med 75 mikrosatelliter

7 Genetisk distance MDS baseret på 96 byg-linier og 75 mikrosatelliter

8 Genetisk distance MDS baseret på 96 byg-linier og 75 mikrosatelliter

9 Sammenligning med afstand fra morfologiske egenskaber

10 Brug af data i andre sammenhænge

11 Eco-TILLING procedure DNA isolation Pooling Genspecifikke primer (2 forskellige farver) PCR reaktion Denaturering Renaturering Tst + Std Std Standard (Std) Tester (Tst) + CEL I

12 Diskrimination af Mla-alleler gennem Eco-TILLING

13 Stamtavle af Adonis med mlo mlo9mlo11