Validering af MALDI-TOF til bakterie og svampeidentifikation

Præsentationer af emnet: "Validering af MALDI-TOF til bakterie og svampeidentifikation"— Præsentationens transcript:

1 Validering af MALDI-TOF til bakterie og svampeidentifikation
Et oplæg Thøger Gorm Jensen

2 Trin Se identifikation med egne øjne, mavefornemmelse
Proof of concept Parallel-identifikation med konventionel identifikation af stort antal bakterielle isolater fra rutinedyrkninger. Gold-standard (16S) ved uoverensstemmelse. (Publikation: Foredrag) Lokal gyldighed (laboratorium og i tid) Identifikation (Biotyper, Saramis) af mellemstort antal kendte og velbeskrevne isolater af gærsvampe og anaerobe bakterier. (Publikation: 2 artikler samt foredrag og postere) Indgår i baggrundslitteratur. Påpeger problemer. Gyldighed afhængig af database-version IVD-godkendelser (Biotyper, Vitek MS) og FDA-godkendelse (Vitek MS) Bruger vi de godkendte database og softwareversioner? Opmærksomhed på forbehold? Konfirmatoriske test hvor påkrævet?

3 ISO verifikation Dansk standardudvalg på 30 eller 50 referencestammer til verifikation ved start og ved større databaseopdateringer? Link Mindre lokalt fastlagt udvalg (4-5 stammer) til kontrol af nyt lot af matrix, ibrugtagning efter reparation m.v. (sørg for sammenfald med EUCAST-kontrolstammer)

4 Hvilke identifikationer skal accepteres?
Lokale eller nationale acceptgrænser? Positivliste (liste med speciesnavne der godkendes hvis scoren er OK)? Kriterier for at komme på positivlisten? Øvrige skal konfirmeres eller besvares på genusniveau? Konfirmation Andet MALDI-TOF system? 16S/LSU Specifik PCR (f.eks. gonokokker)

5 Lokale regler for hyppige identifikationsproblemer
Lokale regler for hyppige ambivalente diagnoser f.eks. Enterobacter aerogenes/Klebsiella pneumoniae Lav score F.eks. Candida species på Biotyper Reproducerbarhed Mellem f.eks. Biotyper og Vitek MS

6 National eller lokal opgave?
Udvælgelse af lister over referencestammer til verifikation? Kørsel af den store liste med referencestammer Lokalt hver gang? Et sted i DK for hvert system? Hvad med forskelle i matrix og acceptkriterier? Acceptkriterier? Regler for håndtering af identifikationskriterier?