Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.

Præsentationer af emnet: "Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”."— Præsentationens transcript:

1 Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Enhedens navn Sted og dato Dias 1 Nytten av metabolomikk i kreftforskning Lars Ove Dragsted Nutrition, Exercise and Sports

2 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Enhedens navn Sted og dato Dias 2 Nytten av metabolomikk i kreftforskning -Introduksjon till metabolomikk -Biomarkører og objektive mål for inntak av mat -Eksplorative undersøkelser av kreftrisiko

3 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Metabolomics Enhedens navn Sted og dato Dias 3 Metabolomics is the comprehensive determination of all small molecules (<~1500 Da) in a biological specimen Includes endogenous and exogenous metabolites May be targeted (e.g. all amino acids) and quantitative or untargeted (e.g. everything the spectrometer reads) and semiquantitative

4 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Why Metabolomics? Slide 4 Metabolomics Proteomics Genomics PHENOTYPE Metabolites are downstream products of gene expression and/or food intake so they reflect the functional level. Metabolites are the result of the interaction of the system’s genome(s) with its environment. Dynamic & time sensitive. Metabolomics Genomics Proteomics Response Time

5 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Study Design Study Design Data preprocessing Data preprocessing Data Analysis Data Analysis Identification Biology Study Design Study Design Exploratory Research Question Exploratory Research Question Analytical Methods Data preprocessing Data preprocessing Data Analysis Data Analysis Identification LC-MS Biology Metabolomics Pipeline Slide 5 Samples Analytical Methods

6 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Biomarker search by metabolomics We search for biomarkers that may be useful for three main purposes: 1)As specific food intake or compliance markers 2)As markers of feeding state or health state 3)As markers explaining the biological changes associated with dietary change or dietary habits The strategy may include performing metabolomics in 1)Animal studies to evaluate potential markers in a highly controlled environment 2)Meal studies in humans to evaluate time-course and individual variation 3)Randomized Controlled Trials in humans to validate potential compliance markers and to explore the physiological effect of diet 4)Biobanked samples from observational studies to explore and/or validate markers that may be useful in epidemiology

7 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Apple markers -Effect of study design Study design helps control variation: Observational studies >300 features >40 features ~ 4-20 features metabotype Controlled human trials Inbred animals Corticosteron e Leucine 3-indole propionic acid Unknow n LysoPC(22:5 ) LysoPC (22:4)

8 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Markører for rygning Vi finder de forventede markører, der afspejler et højt niveau af nikotinmetabolitter i plasma hos rygerne. Øvrige markører omfatter lavt niveau af aromatiske aminosyrer, ubiquinone Q1, bilirubin og højere niveau af frie fedtsyrer.

9 Search for phenotypic markers of coffee intake: Plasma markers of coffee intake from DCH cohort Distribution of ANOVA P-values for 670 features in negative mode after testing their relationship to reported coffee intake.

10 Search for phenotypic markers of coffee intake: Plasma markers of coffee intake from DCH cohort 1(or 7)-methyluric acid P<10-4 1-Methylxanthine (P<0.0005) Hippuric acid (and daughter) (P<0.001) 5-Acetylamino-6-formylamino-3- methyluracil P<0.002 5-Acetylamino-6-amino-3- methyluracil P<10 -3

11 Search for specific markers of coffee intake: Plasma markers of coffee effect from DCH cohort Cafestol P<10 -5

12 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Nutritional sources of variation – whole diets Examples of Diets revealed by metabolomics High/low fibre Low/high GI spirostanols Alkyl resorcinol metabolites Creatine TMAO New Nordic? High/low protein Atkins’ diet Beta-hydroxybutyrate ADD NND

13 Place, date, unit, occasion etc. Slide 13 Metabolomics of meat intake Stella et al., J. Proteome Res.. 5 (2004) 2780-2788

14 Place, date, unit, occasion etc. Slide 14 Metabolomics of meat intake Stella et al., J. Proteome Res.. 5 (2004) 2780-2788

15 Place, date, unit, occasion etc. Slide 15 Comparison of meat intake biomarkers of excretion in a 15 d metabolic suite cross-over study Data from Cross, A. et al (2011) Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2011 June ; 20(6): 1107–1111. doi:10.1158/1055-9965

16 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Whey compared to casein, gluten and cod Department of Nutrition, Exercise and Sports Fish markers ● Casein ● Cod ● Gluten ● Whey

17 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Nordic and non-nordic food items Examples of foods revealed by metabolomics Fish (fat or lean) Citrus Cabbage Parsley Onion Whole grain Rye and wheat

18 Other sources of variation Examples of life style factors or phenotypic variation revealed by metabolomics Age Overweight NSAID usage Irregular periods Coffee drinking Smoking Cafestol P<10 -5 Alcohol intake Circadian rhytm Time since last meal Krug et al. FASEB J. Online Mar 2012 Dallman et al. PNAS (2012) 109:2625-9

19 Tekst starter uden punktopstilling For at få punkt- opstilling på teksten, brug forøg indrykning For at få venstre- stillet tekst uden punktopstilling, brug formindsk indrykning Overskrift her For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Cancers and other chronic diseases Examples of medical conditions revealed by metabolomics Celiac disease IBD other gut conditions Skizofrenia Metabolic syndrome CVD BC Ovarian cancer Total lysophosphatides Proline metabolism Glucose metabolism Fan et al. (2012) Acta Oncol. 51;473 Zhang et al. (2012) Clin Chim Acta 413; 861 Oresic et al (2012) Genome Med. 3; 19

20 Metabolomics and the individual Single food items Medical conditions and medicines Gut microbiota Physical activity Time since last meal Circadian rhytm ”Metabotype” Diet (nutritype) Personal habits (life style) Genetics

21 Conclusion Metabolomics is a useful tool to explore the phenotypic state as well as changes following exposures and to identify potential biomarkers. Markers of life style and dietary habits, including muscle protein intake from fish or meat are readily observed along with markers of altered endogenous metabolism and altered gut microbial metabolism. Markers predicting cancer risk may be found, however a certain pattern of markers may be more likely for risk prediction The complex data is key to a better understanding of intra- and inter-individual variation, compliance, risk prediction and disease prognosis

22 For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”. Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod Byt billede: Ny slide og klik på ikon, indsæt billede Enhedens navn Dias 22 Sted og dato