Præsentation er lastning. Vent venligst

Præsentation er lastning. Vent venligst

Genomics and colon cancer Electronic data exchange Inge Bernstein The Danish HNPCC-register, Hvidovre Hospital, Denmark.

Offentliggjort afKarl Carstensen Redigeret for ca. et år siden

Lignende præsentationer

Præsentationer af emnet: "Genomics and colon cancer Electronic data exchange Inge Bernstein The Danish HNPCC-register, Hvidovre Hospital, Denmark."— Præsentationens transcript:

1 Genomics and colon cancer Electronic data exchange Inge Bernstein The Danish HNPCC-register, Hvidovre Hospital, Denmark

2 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Hereditary Colon cancer HNPCC : 3-6% of CRC 3-6% Inherited risk CRC: up to 35%

3 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Reduced incidence CRC > 60% Earlier detection CRC Better survival CRC Cost-effective HNPCC identification & screening

4 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Sporadic4% Lifetime risk - CRC

5 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Sporadic4% One relative6% Lifetime risk - CRC

6 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Sporadic4% One relative6% Two relatives17% Lifetime risk - CRC

7 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Sporadic4% One relative6% Two relatives17% At risk HNPCC 40-45% Lifetime risk - CRC

8 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Sporadic4% One relative6% Two relatives17% At risk HNPCC 40-45% Gene carrier HNPCC 80-90% Lifetime risk - CRC

9 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Family level Pedigree Individual level Cancers – prelesions Mutations – SNP Risk estimation – surveillance programs Phenotype – Genotype

10 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Referral CPR-Reg, journals, Death certificates Pedigree No Surveillance No Surveillance HNPCC No Mutation Detected Fam.members offered Gen.test (diagnose) Surveillance No Yes Gen.test (screening) Surveillance Yes, and DNA is available Yes, but no DNA available Mutation Surveillance No Surveillance No Surveillance YesNo Data flow HNPCC Gen. dept Sur.dept Lab.

11 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Kennedy Panum Rigshospital Odense HNPCC-register Vejle Århus Genetic departments Collaborators

12 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Rigshospital Skejby Laboratories Ålborg Collaborators Hvidovre

13 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Glostrup Herlev Odense Vejle Skejby Hillerød Helsingør Frederikssund Roskilde Køge Næstved Nykøbing-Falster Kalundborg Svendborg Holbæk Rigshospital Hvidovre Bispebjerg Frederiksberg Gentofte Sønderborg Haderslev Tønder Esbjerg Fredericia Horsens Kolding Holstebro Herning Silkeborg Randers Viborg Skive Nykøbing-Thisted Hjørring-Brønderslev Frederikshavn-Skagen Ålborg Slagelse Bornholm Åbenrå Acknowledgement Surgical departments Hvidovre Collaborators

14 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Glostrup Herlev Odense Vejle Skejby Hillerød Helsingør Frederikssund Roskilde Køge Næstved Nykøbing-Falster Kalundborg Svendborg Holbæk Rigshospital Hvidovre Bispebjerg Frederiksberg Gentofte Sønderborg Haderslev Tønder Esbjerg Fredericia Horsens Kolding Holstebro Herning Silkeborg Randers Viborg Skive Nykøbing-Thisted Hjørring-Brønderslev Frederikshavn-Skagen Ålborg Slagelse Acknowledgement Gynaecologic departments Hvidovre Collaborators

15 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Herlev Odense Vejle Skejby Hillerød Roskilde Næstved Nykøbing-Falster Kalundborg Svendborg Holbæk Rigshospital Hvidovre Bispebjerg Sønderborg Esbjerg Fredericia Horsens Holstebro Herning Randers Viborg Skive Hjørring-Brønderslev Ålborg Slagelse Acknowledgement Pathology departments Hvidovre Collaborators

16 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer 6 genetic dept. 4 laboratories 40 surg.dept. >30 gyn.dept. 25 path.dept HNPCC-register Today: Paper based Aims: Interoperability Communication Further IT-support Web-reporting of data

17 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Invited departments Genetic Department Århus Odense Vejle Hvidovre Surgical Department Herning Ålborg Odense Hvidovre Århus Laboratory Ålborg Copenhagen Hvidovre Århus WP 6.4 Genomics and colon cancer

18 Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer

19 Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer

20 Final Review, Brussels, 28 September 2007 HNPCC - standards Family data - Phenotype Individual data - Phenotype Mutations/SNPs - Genotype Surveillance - Phenotype WP 6.4 Genomics and colon cancer

21 Genetic Diseases International HNPCC DENMARK Other ? GER- MANY Polyposis Breast Cancer Onco- genetic FIN- LAND SWE- DEN National

22

23 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Design of XML documents WEB-client: open source Danish Centre for Health Telematics

24 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Clinical contentXML SchemasImplementation HL7 compliance HL7 standard FORTH WP 6.4 Genomics and colon cancer WEB-client

25 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Danish Health Data Network Web Server Laboratory / Surgery Dep. / Genetic Dep. Web Service Provider Front end HNPCC DB HTML Web ServiceNot part of InfoBioMed Web Page ClientWeb Service Client Vali- dation WP 6.4 Genomics and colon cancer

26 Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer

27 Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer

28 Final Review, Brussels, 28 September 2007 I:1I:2 II:1II:2II:4II:3 III:1III:2III:3III:5III:4III:6 ** * * ** Colon cancer Other HNPCC cancer Healthy Dead At risk Max Bergren

29 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Genetic Department Århus Odense Vejle Hvidovre Surgical Department Herning Ålborg Odense Hvidovre Århus Laboratory Ålborg Copenhagen Hvidovre Århus WP 6.4 Genomics and colon cancer II:1 Max Bergren

30 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007

31 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007

32 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 I:1I:2 II:2II:4II:3 III:1III:2III:3III:5III:4 III:6 * * * ** Colon cancer Other HNPCC cancer Healthy Dead At risk II:1 * Max Bergren **

33 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 I:1I:2 II:2II:4II:3 III:1III:2III:3III:5III:4 III:6 * * * ** Colon cancer Other HNPCC cancer Healthy Dead At risk II:1 * **

34 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 I:1I:2 II:2II:4II:3 III:1III:2III:3III:5III:4 III:6 * * * ** Colon cancer Other HNPCC cancer Healthy Dead At risk II:1 * Max Bergren ** Mutation detection

35 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 MLH1, exon4, c.350C>T, p.T117M Genetic Department Århus Odense Vejle Hvidovre Surgical Department Herning Ålborg Odense Hvidovre Århus Laboratory Ålborg Copenhagen Hvidovre Århus WP 6.4 Genomics and colon cancer

36 Final Review, Brussels, 28 September 2007

37 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 I:1I:2 II:1II:2II:4II:3 III:1III:2III:3III:5III:4III:6 ** * * ** Colon cancer Other HNPCC cancer Healthy Dead Offered gene test **

38 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 System implemented Genetic Department Århus Odense Vejle Hvidovre Surgical Department Herning Ålborg Odense Hvidovre Århus Laboratory Ålborg Copenhagen Hvidovre Århus WP 6.4 Genomics and colon cancer

39 Final Review, Brussels, 28 September 2007 134 XML – 87% Surgical dept WP 6.4 Genomics and colon cancer

40 Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer

41 Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer

42 Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer 67% increase surveillance reports

43 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Gaps identified Lack of Standards Local databases Time-consuming Implementation Reporting Interest – Feed-back WP 6.4 Genomics and colon cancer

44 Final Review, Brussels, 28 September 2007 Current status data exchange HNPCC 4 XML standards on clinical content Design of XML documents WEB service client Experience –Implementation –Evaluation –Dissemination –Early HL7 and CDA experience –Ethical, legal and security issues Specific outcome

45 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 WP 6.4 Genomics and colon cancer

46 Final Review, Brussels, 28 September 2007 Skejby Laboratories Ålborg Grant – Database Minister of health Hvidovre

47 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 New Castle 2005 Cologne 2006 Yokohama 2007 Majorca 2006 EU Majorca 2007 EU

48 WP 6.4 Genomics and colon cancer Final Review, Brussels, 28 September 2007 Australia - Melbourne Belgian - Brussel Spain - Barcelona Holland - Leiden Lund - Sweden Interested

Download ppt "Genomics and colon cancer Electronic data exchange Inge Bernstein The Danish HNPCC-register, Hvidovre Hospital, Denmark."

Lignende præsentationer

Behandling med ICD Status efter ændrede rekommandationer

Behandling med ICD Status efter ændrede rekommandationer
VIS HJÆLPELINJER SOM ER EN HJÆLP VED PLACERING AF LOGO: 1.Højreklik på den aktuelle side og vælg ’gitter og hjælpelinjer’ 2. Sæt kryds ved ’Vis’ tegnehjælpelinjer.

VIS HJÆLPELINJER SOM ER EN HJÆLP VED PLACERING AF LOGO: 1.Højreklik på den aktuelle side og vælg ’gitter og hjælpelinjer’ 2. Sæt kryds ved ’Vis’ tegnehjælpelinjer.
1. november 2007 Carl P. Knudsen

1. november 2007 Carl P. Knudsen
VIS HJÆLPELINJER SOM ER EN HJÆLP VED PLACERING AF LOGO: 1.Højreklik på den aktuelle side og vælg ’gitter og hjælpelinjer’ 2. Sæt kryds ved ’Vis’ tegnehjælpelinjer.

VIS HJÆLPELINJER SOM ER EN HJÆLP VED PLACERING AF LOGO: 1.Højreklik på den aktuelle side og vælg ’gitter og hjælpelinjer’ 2. Sæt kryds ved ’Vis’ tegnehjælpelinjer.
Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.

Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.
Indsæt nyt billede: Format: B 254 x 190,5 mm Efter indsættelse, højreklik på billedet og placér det bagerst. Delete det gamle foto Legal aid in Denmark.

Indsæt nyt billede: Format: B 254 x 190,5 mm Efter indsættelse, højreklik på billedet og placér det bagerst. Delete det gamle foto Legal aid in Denmark.
Teknik og Miljø - Planlægning og Byggeri Aarhus Kommune •Flemming Meyer •Master of Law, Special Consultant •Municipality of Aarhus •Department of employment.

Teknik og Miljø - Planlægning og Byggeri Aarhus Kommune •Flemming Meyer •Master of Law, Special Consultant •Municipality of Aarhus •Department of employment.
12 SEPTEMBER 2012 VELKOMMEN TIL BRUGERSEMINAR 2012 1 Velkommen til brugerseminar 2012 Odeum gruppen.

12 SEPTEMBER 2012 VELKOMMEN TIL BRUGERSEMINAR Velkommen til brugerseminar 2012 Odeum gruppen.
VIS HJÆLPELINJER SOM ER EN HJÆLP VED PLACERING AF LOGO: 1.Højreklik på den aktuelle side og vælg ’gitter og hjælpelinjer’ 2. Sæt kryds ved ’Vis’ tegnehjælpelinjer.

VIS HJÆLPELINJER SOM ER EN HJÆLP VED PLACERING AF LOGO: 1.Højreklik på den aktuelle side og vælg ’gitter og hjælpelinjer’ 2. Sæt kryds ved ’Vis’ tegnehjælpelinjer.
Indsæt nyt billede: Format: B 254 x 190,5 mm Efter indsættelse, højreklik på billedet og placér det bagerst. Delete det gamle foto New production system.

Indsæt nyt billede: Format: B 254 x 190,5 mm Efter indsættelse, højreklik på billedet og placér det bagerst. Delete det gamle foto New production system.
Brødtekst her Brødtekst starter uden bullets, hvis du vil have bullets brug ”Forøge / Formindske indryk” for at få de forskellige niveauer frem Overskrift.

Brødtekst her Brødtekst starter uden bullets, hvis du vil have bullets brug ”Forøge / Formindske indryk” for at få de forskellige niveauer frem Overskrift.
Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.

Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.
0 Patienter og pårørende i fremtidens hospital Telemedicinske løsninger og muligheder.

0 Patienter og pårørende i fremtidens hospital Telemedicinske løsninger og muligheder.
Etablering af samordningsudvalg i psykiatrien

Etablering af samordningsudvalg i psykiatrien
Dagens program  Emne: Tim Berners-Lees WWW koncept og deraf følgende innovationer Forbered hver for sig Præsenter og diskutér i grupper Fremlæggelse med.

Dagens program  Emne: Tim Berners-Lees WWW koncept og deraf følgende innovationer Forbered hver for sig Præsenter og diskutér i grupper Fremlæggelse med.
Select one of the 3 title pages and delete the others. Please do not create new title pages by using the layouts Title 1 – 3 as these layouts do not contain.

Select one of the 3 title pages and delete the others. Please do not create new title pages by using the layouts Title 1 – 3 as these layouts do not contain.
Roadshow 2010 Energirigtige løsninger 7. januar 2011.

Roadshow 2010 Energirigtige løsninger 7. januar 2011.
Lone Møller Sørensen Director, SBi, Aalborg University ECTP- Denmark A national platform for Denmark

Lone Møller Sørensen Director, SBi, Aalborg University ECTP- Denmark A national platform for Denmark
1 Omstrukturering af Brønderslev-Dronninglund Vand og Varme 8. december 2006.

1 Omstrukturering af Brønderslev-Dronninglund Vand og Varme 8. december 2006.
Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.

Overskrift her Navn på oplægsholder Navn på KU- enhed For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”: Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.

Lignende præsentationer

Annoncer fra Google